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文檔簡介
1、基因芯片技術(shù)的概念來自計算機芯片,發(fā)展至今不到二十年?;蛐酒夹g(shù)以其大規(guī)模、快速、高效的獲取相關(guān)生物信息而聞名?;蛐酒脑夹畔⒍假A存在基因芯片圖像中。圖像文件中并沒有直接信號值,如靶點強度值、背景強度值等信息,必須通過圖像處理提取才能得到各靶點的相應(yīng)數(shù)據(jù)信息。本文在基因芯片圖像處理與數(shù)據(jù)提取方面進(jìn)行了有意義的研究。
首先,在基因芯片圖像預(yù)處理方面,本文根據(jù)基因芯片圖像噪聲的特點以及常用的濾波算法,提出了形狀自適應(yīng)DC
2、T濾波方法。此方法通過變換尺度的定向核自適應(yīng)地為每個像素點選擇鄰域,同時由于離散余弦變換自身的特性,能夠?qū)D像進(jìn)行有效的濾波。通過主觀與客觀評價,相比于其他基因芯片圖像濾波方法,該方法能夠比較好的抑制噪聲。
其次,在靶點分割方面,本文總結(jié)了常用的基因芯片圖像分割方法,提出了改進(jìn)的K-means聚類靶點分割算法。K-means聚類算法在大數(shù)據(jù)量時的擴(kuò)展性和效率都較理想,適用于基因芯片的圖像分割處理。針對K-means聚類算法
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