CO1在側(cè)耳屬物種快速鑒定中的應(yīng)用.pdf

1、本文以側(cè)耳屬(Pleurotus)16個主要種為試驗(yàn)材料,根據(jù)實(shí)驗(yàn)室已有的側(cè)耳屬CO1基因序列信息,設(shè)計(jì)引物CO332F和CO332R,以cDNA為模板PCR擴(kuò)增CO1的編碼區(qū)序列,擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)克隆、測序。使用軟件DNAMAN和ClustalX分析試驗(yàn)材料的CO1編碼區(qū)序列,結(jié)果表明:側(cè)耳屬種間CO1編碼區(qū)序列比較保守,序列同源性在0.888-1.000之間。
　　 結(jié)合側(cè)耳屬CO1編碼區(qū)序列和CO1基因序列,進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn)側(cè)耳屬

2、CO1序列間的差異主要在于內(nèi)含子,其中,P.ostreatus、P.citrinopileatus、P.cornucopiae和P.eryngii var.moliensis序列大小分別為:1777 bp、1675 bp、2059bp和1718 bp,序列間有1個內(nèi)含子插入；P.eryngii、P.pulmonarius、P.abieticola、P.tuber-regium和P.rattenburyi序列大小分別為:3454 bp、3

3、462 bp、3441 bp、3631 bp和4913 bp,序列間有2個內(nèi)含子插入；P.australis和P.smithii序列大小分別為:4641 bp和4453bp,序列間有3個內(nèi)含子插入；而P.calyptratus、P.cystidiosu、P.djamor、P.dryinus和P.eryngii var.ferulae序列間無內(nèi)含子插入,大小均為321 bp。
　　 為了更加快速的鑒定側(cè)耳屬屬內(nèi)各種,本文以引物CO

4、332F和CO332R為基礎(chǔ)進(jìn)行PCR擴(kuò)增,可先將PCR擴(kuò)增產(chǎn)物按條帶大小分為四組,第一組為P.calyptratus、P.cystidiosu、P.djamor、P.dryinus和P.eryngii var.ferulae;第二組為P.ostreatus、P.citrinopileatus、P.cornucopiae和P.eryngii var.moliensis;第三組為P.eryngii、P.pulmonarius、P.abie