2023年全國(guó)碩士研究生考試考研英語(yǔ)一試題真題(含答案詳解+作文范文)_第1頁(yè)
已閱讀1頁(yè),還剩59頁(yè)未讀, 繼續(xù)免費(fèi)閱讀

下載本文檔

版權(quán)說(shuō)明:本文檔由用戶(hù)提供并上傳,收益歸屬內(nèi)容提供方,若內(nèi)容存在侵權(quán),請(qǐng)進(jìn)行舉報(bào)或認(rèn)領(lǐng)

文檔簡(jiǎn)介

1、MicroRNA(miRNA)是一類(lèi)長(zhǎng)度為22個(gè)堿基左右的非編碼RNA,主要通過(guò)抑制靶mRNA翻譯或促使其降解的方式實(shí)現(xiàn)對(duì)靶基因的轉(zhuǎn)錄后調(diào)控。miRNA在許多生物學(xué)過(guò)程中起著極其關(guān)鍵的調(diào)控作用,包括生長(zhǎng)發(fā)育、細(xì)胞增值、組織分化和疾病發(fā)生等。對(duì)miRNA的系統(tǒng)性分析有利于miRNA調(diào)控功能的研究、疾病靶標(biāo)的發(fā)現(xiàn)和機(jī)理的研究。
  二代測(cè)序技術(shù)的發(fā)展與應(yīng)用為miRNA的分析提供了數(shù)據(jù)基礎(chǔ),尤其是小RNA測(cè)序數(shù)據(jù)。本研究從NCBI的SR

2、A數(shù)據(jù)庫(kù)中收集了741個(gè)人類(lèi)小RNA測(cè)序數(shù)據(jù)集,以及自主測(cè)序的5個(gè)小RNA測(cè)序數(shù)據(jù)集,經(jīng)過(guò)質(zhì)量控制篩選得到來(lái)自24種不同的組織/疾病/細(xì)胞系的410個(gè)數(shù)據(jù)集。通過(guò)實(shí)驗(yàn)室自主搭建的小RNA測(cè)序數(shù)據(jù)分析流程,系統(tǒng)分析了miRNA的表達(dá)情況,并開(kāi)發(fā)了miRNA表達(dá)譜數(shù)據(jù)庫(kù)HMED,網(wǎng)址為http://bioinfo.life.hust.edu.cn/smallRNA/。數(shù)據(jù)庫(kù)按照不同的組織/疾病/細(xì)胞系展示了miRNA的表達(dá)情況。
  

3、特異性表達(dá)的miRNA一般在相應(yīng)的組織/疾病/細(xì)胞系中起著關(guān)鍵調(diào)控作用,也更有可能作為組織和疾病的標(biāo)志物。我們?cè)O(shè)計(jì)了香農(nóng)熵和標(biāo)準(zhǔn)分值(Z score)相結(jié)合的鑒定特異表達(dá)miRNA的篩選方法。用香農(nóng)熵度量miRNA在組織/疾病/細(xì)胞系中表達(dá)的集中度,用標(biāo)準(zhǔn)分值度量miRNA表達(dá)的離群程度。使用這個(gè)方法,我們鑒定了41個(gè)在組織/疾病/細(xì)胞系中特異表達(dá)的miRNA和17個(gè)選擇性表達(dá)在2種組織中的miRNA。我們還發(fā)現(xiàn)相對(duì)于其他組織,腦組織、

4、睪丸組織和HEK293T細(xì)胞系中特異表達(dá)的miRNA較多。另外,我們對(duì)疾病樣本及其正常對(duì)照樣本進(jìn)行了差異表達(dá)分析,在乳腺癌、肺癌、肝癌和牛皮癬4種疾病中分別鑒定出了51、41、8、2個(gè)表達(dá)差異顯著的miRNAs。這些miRNA有利于相應(yīng)疾病的研究以及miRNA調(diào)控功能的揭示。
  miRNA靶基因研究是miRNA功能研究的基礎(chǔ)。我們整合了Targetscan、miRanda、RNAhybrid和PITA4個(gè)miRNA靶基因預(yù)測(cè)數(shù)據(jù)

5、庫(kù)結(jié)果,以及TarBase、miRTarBase、miR2Disease、miRecords4個(gè)靶基因?qū)嶒?yàn)驗(yàn)證數(shù)據(jù)庫(kù),構(gòu)建了全面的miRNA靶基因數(shù)據(jù)集,并結(jié)合GO、KEGG、Biocarta、Reactome4個(gè)功能數(shù)據(jù)集,基于java開(kāi)發(fā)了miRNA靶基因功能分析工具EasymiR。該工具可用于miRNA靶基因數(shù)據(jù)的篩選、靶基因功能富集分析和miRNA靶基因關(guān)系圖繪制。
  總之,本文工作對(duì)大規(guī)模小RNA測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行了系統(tǒng)全面

溫馨提示

  • 1. 本站所有資源如無(wú)特殊說(shuō)明,都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請(qǐng)下載最新的WinRAR軟件解壓。
  • 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等,如果需要附件,請(qǐng)聯(lián)系上傳者。文件的所有權(quán)益歸上傳用戶(hù)所有。
  • 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙,網(wǎng)頁(yè)內(nèi)容里面會(huì)有圖紙預(yù)覽,若沒(méi)有圖紙預(yù)覽就沒(méi)有圖紙。
  • 4. 未經(jīng)權(quán)益所有人同意不得將文件中的內(nèi)容挪作商業(yè)或盈利用途。
  • 5. 眾賞文庫(kù)僅提供信息存儲(chǔ)空間,僅對(duì)用戶(hù)上傳內(nèi)容的表現(xiàn)方式做保護(hù)處理,對(duì)用戶(hù)上傳分享的文檔內(nèi)容本身不做任何修改或編輯,并不能對(duì)任何下載內(nèi)容負(fù)責(zé)。
  • 6. 下載文件中如有侵權(quán)或不適當(dāng)內(nèi)容,請(qǐng)與我們聯(lián)系,我們立即糾正。
  • 7. 本站不保證下載資源的準(zhǔn)確性、安全性和完整性, 同時(shí)也不承擔(dān)用戶(hù)因使用這些下載資源對(duì)自己和他人造成任何形式的傷害或損失。

最新文檔

評(píng)論

0/150

提交評(píng)論