ATG基因調(diào)控酵母自噬的系統(tǒng)研究.pdf

1、細胞自噬（Autophagy）是高度保守的生物過程，是細胞維持完整性、內(nèi)穩(wěn)態(tài)和存活所必需的。細胞自噬主要有三種形式：巨自噬（Macroautophagy）、微自噬（Microautophagy）和分子伴侶介導的自噬（Chaperone-mediated autophagy, CMA），在本論文中提到的自噬單指巨自噬。
　　自噬異常與許多種疾病相關(guān)。因此，自噬分子機制的深入研究非常必要。哺乳動物中自噬相關(guān)基因在酵母中有相應的同源物，

2、說明自噬過程高度保守。因此，酵母中的自噬研究可為哺乳動物中自噬研究提供新的思路。目前，在酵母中已經(jīng)發(fā)現(xiàn)40個自噬相關(guān)基因（AuTophaGy-related gene,ATG）。酵母（Yeast）具有繁殖快、培養(yǎng)方便和遺傳操作簡單等特點，許多實驗可以在酵母中開展來研究自噬發(fā)生各個階段。因此，本研究選擇酵母作為模式生物進行自噬相關(guān)研究。
　　本工作以釀酒酵母為研究對象，在減氮饑餓條件下，通過觀察0-4h內(nèi)GFP-ATG8在酵母液泡內(nèi)

3、外的動態(tài)變化，對28個ATG基因敲除菌進行分析并分類，同時對減氮自噬關(guān)鍵ATG蛋白質(zhì)磷酸化進行生物信息學分析。減氮處理后，根據(jù)實驗結(jié)果表型將減氮自噬相關(guān)基因分為兩類：減氮自噬關(guān)鍵基因和減氮自噬無影響基因。
　　減氮自噬相關(guān)基因分類后，本工作根據(jù)酵母蛋白質(zhì)磷酸化位點數(shù)據(jù)，整理出18個ATG蛋白質(zhì)的125個磷酸化位點，用iGPS軟件預測自噬基因表達蛋白質(zhì)位點特異性激酶，共得出13個ATG蛋白的53個蛋白激酶，并構(gòu)建ATG蛋白質(zhì)及其激酶