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1、實(shí)驗(yàn)?zāi)康模?1三體綜合征是由于21號(hào)染色體不分離所導(dǎo)致的一種染色體病,表現(xiàn)為嚴(yán)重的智力發(fā)育障礙和多發(fā)性先天畸形,是臨床最常見的嚴(yán)重出生缺陷之一,由于該病缺乏有效的治療手段,給社會(huì)、家庭帶來異常沉重的負(fù)擔(dān),因而進(jìn)行孕早期篩查和產(chǎn)前染色體診斷是降低其發(fā)生率的有效途徑。但目前仍未見21三體患者CpG島DNA甲基化狀態(tài)的相關(guān)報(bào)道,因此,研究21三體患者CpG島甲基化狀態(tài),這對(duì)探索更有效、更特異的用于21三體產(chǎn)前風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估的表觀遺傳學(xué)分子靶點(diǎn)具有重
2、要的科學(xué)意義和臨床實(shí)踐價(jià)值。
實(shí)驗(yàn)方法:運(yùn)用HpaⅡ-McrBC PCR(HM-PCR)方法篩檢分析21qCpG島甲基化狀態(tài)。首先從UCSC數(shù)據(jù)庫(kù)獲得21qCpG島DNA序列,并與華大基因炎黃數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì),驗(yàn)證序列和引物。然后建立HM-PCR檢測(cè)方法,并利用HM-PCR技術(shù)篩查和分析了150例21三體患者21q上2690個(gè)CpG島,并將患者CpG島甲基化狀態(tài)與正常個(gè)體進(jìn)行比較。
實(shí)驗(yàn)結(jié)果:本研究首先驗(yàn)證了149
3、個(gè)CpG島的DNA序列和148對(duì)CpG島引物的準(zhǔn)確性,明確序列和引物在中國(guó)漢族人群運(yùn)用的可行性。建立了簡(jiǎn)化的HM-PCR方法。HM-PCR篩查發(fā)現(xiàn)21三體患者21號(hào)染色體長(zhǎng)臂的CpG島中,98個(gè)無甲基化,30個(gè)完全甲基化,12個(gè)雜合甲基化,8個(gè)不完全甲基化,在健康個(gè)體21號(hào)染色體長(zhǎng)臂的148個(gè)CpG島中也得到完全相同結(jié)果。有4個(gè)雜合甲基化CpG島(編號(hào):11,15,27,71)與日本人存在差異,日本人群呈現(xiàn)出無甲基化狀態(tài);有1個(gè)雜合甲基
4、化CpG島(編號(hào):93)與日本人不一致,日本人群呈現(xiàn)出完全甲基化狀態(tài)。這種差異是否是種族之間的差異,尚需對(duì)這5個(gè)CpG島進(jìn)行重亞硫酸鹽測(cè)序確認(rèn)。第103號(hào)CpG島沒有HpaⅡ和HhaⅠ酶切位點(diǎn),因此,需要利用重亞硫酸鹽測(cè)序檢測(cè)。
實(shí)驗(yàn)結(jié)論:21三體患者與健康個(gè)體之間在21qCpG島上不存在DNA甲基化狀態(tài)的差異;21qCpG島DNA甲基化狀態(tài)在同一種族內(nèi)高度一致,那么21qCpG島DNA甲基化狀態(tài)可否為種族間識(shí)別的表觀遺傳
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