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文檔簡介
1、人腸道病毒71型(human enterovirus71,HEV71)為腸道病毒A組單股正鏈RNA病毒,是手足口病(hand-foot-and-mouth disease,HFMD)主要病原體。HEV71殼粒由VP1~VP4四種病毒蛋白組成,其中VP1具有細胞受體結合位點、中和抗體表位及抗病毒藥物結合位點,故VP1在病毒感染、抗病毒免疫應答及藥物治療效果等方面有重要作用。若VP1功能相關重要位點發(fā)生突變,可使HEV71毒力和耐藥性發(fā)生改
2、變,從而對HFMD患者病情嚴重程度產(chǎn)生較大影響。HEV71的VP1序列中有一個微小RNA病毒衣殼蛋白樣(picornavirus capsid protein domain-like,rhv_like)功能結構域(domain),該結構域含有9個藥物結合位點。根據(jù)VP1序列差異, HEV71可分為A、B0~5和C1~5基因型,不同地區(qū)流行的主要HEV71-VP1基因型可有差異。因此,了解不同地區(qū)優(yōu)勢流行的HEV71VP1基因型及其rhv
3、_like結構域中藥物結合位點突變對于HFMD防控及治療均有較大意義。
目的:從不同病情HFMD患兒中分離鑒定HEV71并分析其VP1基因型及rhv_like結構域中藥物結合位點突變情況。
方法:從2014年浙江省紹興地區(qū)4例輕癥和4例重癥HFMD患兒標本中分離HEV71并用RT-PCR進行鑒定。采用RT-PCR擴增病毒分離株全長VP1基因并測序。采用專業(yè)生物信息學軟件,對HEV71分離株進行VP1基因分型、確定VP
4、1基因rhv_like結構域中藥物結合位點突變情況并構建HEV71分離株系統(tǒng)進化樹。
結果:HEV和HEV71RT-PCR檢測結果顯示,8例HFMD患兒標本中分離的病毒均為HEV71。與GenBank中HEV71參考標準株VP1基因各基因型序列比較,8例HFMD患兒標本中分離的HEV71株VP1基因核苷酸及氨基酸序列均與C4a基因型相似性最高,分別為97.2%~98.8%和99.3%~99.7%。2株分離自2例重癥HFMD患兒
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