燕麥β-1，3-葡聚糖酶基因cDNA的克隆及生物信息學(xué)分析.pdf

1、依據(jù)GenBank中β-1，3-葡聚糖酶基因的保守序列設(shè)計引物，通過反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(RT-PCR)和快速分離cDNA末端(RACE)技術(shù)擴(kuò)增得到燕麥β-1，3-葡聚糖酶(Oglc13)基因全長。通過因特網(wǎng)數(shù)據(jù)及生物信息學(xué)分析工具進(jìn)行初步分析表明，該cDNA全長由1191個堿基組成，包含一個1008bp組成的完整開放閱讀框(ORF)，終止密碼子TGA，在起始密碼上游有一個由49個堿基組成的5’非編碼區(qū)；在終止密碼下游有一個由121個

2、堿基組成的3’非編碼區(qū)，包括1個加poly(A)信號和一個長度為13個腺苷酸的poly(A)尾。 Oglc13推測的氨基酸序列與已發(fā)表的大麥、小麥、水稻、黑麥的β-1，3-葡聚糖酶氨基酸序列的同源性為70％-77％；Oglc13基因編碼的蛋白是一種相對分子量為35479.30a、等電點為8.81的疏水跨膜蛋白，富含Ala、Val、Arg；二級結(jié)構(gòu)有12個α螺旋、12個片層、22個無規(guī)卷曲，具有葡萄糖苷水解酶17家族成員的標(biāo)簽序