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文檔簡(jiǎn)介
1、河豚魚(yú)[Takifugu Rubripes],俗稱(chēng)河鲀,隸屬于硬骨魚(yú)綱、純形目、純科。河豚魚(yú)是我國(guó)重要的海洋漁業(yè)種類(lèi),具有較高的食用和經(jīng)濟(jì)價(jià)值。
河豚魚(yú)基因組測(cè)序計(jì)劃已被納入人類(lèi)基因組計(jì)劃,作為人類(lèi)基因組的藍(lán)本,并于2002年首次完成了河豚魚(yú)基因組的測(cè)序。隨著河豚魚(yú)基因組研究進(jìn)展逐漸加快,使我們需要對(duì)河豚魚(yú)生長(zhǎng)發(fā)育、病理學(xué)、肌肉生長(zhǎng)/品質(zhì)等方面的研究,但目前河豚魚(yú)的研究?jī)H限于基因進(jìn)化和環(huán)境毒理學(xué)上。對(duì)其進(jìn)行蛋白質(zhì)組學(xué)的研究
2、意義重大。目前國(guó)內(nèi)外未見(jiàn)關(guān)于河豚魚(yú)肝、腎蛋白質(zhì)組學(xué)研究的報(bào)道。
本研究以河豚魚(yú)為實(shí)驗(yàn)材料,建立了河豚魚(yú)肝、腎的蛋白質(zhì)組技術(shù)體系,獲得分離較好的蛋白質(zhì)凝膠指紋圖譜。
1.利用蛋白質(zhì)組學(xué)的方法,在河豚魚(yú)肝臟中鑒定到66個(gè)蛋白,其中有26個(gè)蛋白是河豚魚(yú)中新發(fā)現(xiàn)的蛋白質(zhì)。新發(fā)現(xiàn)的蛋白中,代謝相關(guān)蛋白主要包括視黃醇脫氫酶和?;?輔酶A結(jié)合蛋白;遺傳相關(guān)蛋白主要包括TPR結(jié)構(gòu)域蛋白和TAF5-RNA聚合酶Ⅱ;生長(zhǎng)發(fā)育相關(guān)
3、蛋白主要包括SH3結(jié)合蛋白、細(xì)胞周期蛋白D1、透明質(zhì)烷蛋白聚糖連接蛋白、Bonnie-clyde蛋白、tuba1蛋白、鋅指肌動(dòng)蛋白、外表層I型細(xì)胞角蛋白、成蛋白同源蛋白;細(xì)胞過(guò)程相關(guān)蛋白主要包括t-絡(luò)合物多肽的伴侶素、特異性皮膚T細(xì)胞淋巴瘤抗原、β-衣被蛋白復(fù)合物、核膜血影蛋白、驅(qū)動(dòng)蛋白家族5B、細(xì)胞分裂素活化蛋白激酶。
2.利用蛋白質(zhì)組學(xué)的方法,在河豚魚(yú)腎臟中鑒定到38個(gè)蛋白,其中有19個(gè)蛋白是河豚魚(yú)中新發(fā)現(xiàn)的蛋白質(zhì)。新
4、蛋白中代謝相關(guān)蛋白主要包括精氨?;?tRNA合成酶、H+轉(zhuǎn)運(yùn)-ATP合成酶-線粒體F0復(fù)合物b亞基;遺傳相關(guān)蛋白有δ-聚合酶;生長(zhǎng)發(fā)育相關(guān)蛋白有黃素蛋白氧化還原酶和中線蛋白;細(xì)胞過(guò)程相關(guān)蛋白主要包括磷酸酶-肌動(dòng)蛋白調(diào)節(jié)因子、exocyst復(fù)合物、鈣結(jié)合蛋白、角蛋白、膜聯(lián)蛋白。
3.利用HCA、PROSITE和Motif scan等軟件,以SN4TDR蛋白為例建立河豚蛋白質(zhì)組的生物信息學(xué)分析模式,對(duì)SN4TDR蛋白的結(jié)構(gòu)域和
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