涼山半細(xì)毛羊QTL定位初步研究.pdf

1、本研究以我國(guó)自行培育成功的涼山半細(xì)毛羊作為資源群體，對(duì)與實(shí)際生產(chǎn)密切相關(guān)的5個(gè)體重性狀和8個(gè)羊毛性狀進(jìn)行了QTL連鎖分析。體重性狀分別是羔羊初生重、斷奶重、斷奶日增重、育成體重和成年體重；8個(gè)羊毛性狀分別是斷奶羊毛纖維長(zhǎng)度、育成羊毛纖維長(zhǎng)度、成年羊毛纖維長(zhǎng)度、育成腹部羊毛纖維長(zhǎng)度、成年腹部羊毛纖維長(zhǎng)度、育成剪毛量成年剪毛量成年羊毛纖維直徑。 本研究選擇了綿羊1、2、3、9號(hào)染色體上的47個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記，引物經(jīng)熒光標(biāo)記進(jìn)行多重PCR

2、擴(kuò)增，并在ABI310測(cè)序儀上進(jìn)行檢測(cè)。根據(jù)測(cè)定結(jié)果，剔除了14個(gè)擴(kuò)增效果不好的標(biāo)記，選擇了33個(gè)標(biāo)記進(jìn)行分析。 Cervus2.0軟件統(tǒng)計(jì)結(jié)果顯示所選微衛(wèi)星標(biāo)記在涼山半細(xì)毛羊群體中等位基因在3～22個(gè)之間，群體雜合度為0.258～0.867，多態(tài)信息含量為0.245～0.853；各位點(diǎn)排除概率范圍為0.137～0.728，累計(jì)排除概率達(dá)到了0.999999。只有一個(gè)標(biāo)記是低度多態(tài)，其他標(biāo)記均呈現(xiàn)高度或中度多態(tài)性，為該群體分子水

3、平上的研究提供了保障。 利用所選的微衛(wèi)星標(biāo)記對(duì)試驗(yàn)個(gè)體進(jìn)行了親子鑒定，所選標(biāo)記的累積非父排除概率(cumulativeprobabilityofexclusion，CPE)達(dá)到了99.999999％，最終確定了13個(gè)家系，試驗(yàn)個(gè)體總數(shù)為1003只，其中父母代480只、后代591只，最大家系為188家系(181只)，最小家系為S259(20只)。 對(duì)試驗(yàn)群體的591個(gè)后裔的5個(gè)體重性狀和8個(gè)羊毛性狀進(jìn)行了表型資料的簡(jiǎn)單統(tǒng)計(jì)

4、分析。結(jié)果表明：初生和斷奶性狀與育成羊和成年羊的一些性狀成顯著相關(guān)，而且家系效應(yīng)對(duì)某些性狀有顯著影響。 通過(guò)對(duì)所選標(biāo)記進(jìn)行遺傳連鎖分析，構(gòu)建了涼山半細(xì)毛羊基因組1、2、3、9號(hào)染色體的遺傳連鎖圖譜。連鎖圖長(zhǎng)度分別為301.6cM、316.9cM、320.5cM、173.7cM，雖然4條連鎖圖的長(zhǎng)度與英國(guó)羅斯林研究所公布的最新的綿羊遺傳連鎖圖不同，但標(biāo)記順序相同。 利用QTLexpress在線分析程序，選擇半同胞家系模型，

5、用區(qū)間作圖法對(duì)影響上述涼山半細(xì)毛羊5個(gè)體重性狀和8個(gè)羊毛性狀的數(shù)量性狀位點(diǎn)進(jìn)行了QTL定位分析。QTL定位結(jié)果顯示： 在1號(hào)染色體檢測(cè)到了4個(gè)QTL位點(diǎn)，分別是187家系在255cM處檢測(cè)到影響斷奶重的QTL，并達(dá)到了顯著水平；在家系187中249cM處檢測(cè)到影響育成羊剪毛量的QTL，在999家系檢測(cè)到2個(gè)QTL位點(diǎn)，分別為在155cM處檢測(cè)到的影響育成羊腹毛長(zhǎng)的QTL和149cM處檢測(cè)到的影響成年羊腹毛長(zhǎng)的QTL位點(diǎn)，但后面3

6、個(gè)QTL位點(diǎn)未達(dá)到顯著水平。 在2號(hào)染色體檢測(cè)到了11個(gè)QTL位點(diǎn)，分別為：在187家系254cM處和190家系59cM處檢測(cè)到影響初生重的QTL；在187家系的86cM處檢測(cè)到影響斷奶日增重的QTL；在187家系86cM處和190家系67cM處檢測(cè)到影響斷奶毛長(zhǎng)的QTL；在190家系63cM處檢測(cè)到影響斷奶重的QTL；在190家系60cM處和191家系75cM處檢測(cè)到影響育成羊剪毛量的QTL；在191家系79cM處檢測(cè)到影響成

7、年羊剪毛量的QTL；在192家系77cM處檢測(cè)到影響育成重的QTL；在192家系115cM處檢測(cè)到影響育成羊毛長(zhǎng)度的QTL。2號(hào)染色體上檢測(cè)到的11個(gè)QTL位點(diǎn)全部達(dá)到了顯著水平。 在3號(hào)染色體檢測(cè)到了9個(gè)QTL位點(diǎn)，分別為：在187家系79cM處檢測(cè)到影響成年羊毛剪毛量的QTL；在189家系16cM處檢測(cè)到的影響成年羊毛長(zhǎng)度的QTL；在190家系75cM處檢測(cè)到影響斷奶重的QTL；在191家系檢測(cè)到6個(gè)QTL位點(diǎn)，在2cM處檢

8、測(cè)到影響斷奶日增重的QTL，在320cM處檢測(cè)到影響育成重、育成羊毛長(zhǎng)、育成羊腹毛長(zhǎng)以及育成羊剪毛量的QTL，在191家系252cM處還檢測(cè)到了影響羊毛纖維直徑的QTL，雖然該位點(diǎn)未達(dá)到顯著水平，但該位點(diǎn)與標(biāo)記BMC1009高度連鎖，這與Allain(1996)報(bào)道的結(jié)果一致。 在9號(hào)染色體共檢測(cè)到了12個(gè)QTL位點(diǎn)。186家系檢測(cè)到了3個(gè)QTL位點(diǎn)，分別為：在173cM處影響初生重的QTL；在0cM處檢測(cè)到的影響育成體重的QT

9、L，在5cM處檢測(cè)到了影響成年羊體重的QTL。187家系檢測(cè)到了5個(gè)QTL位點(diǎn)，分別為：在98cM處檢測(cè)到了影響成年羊體重的QTL；151cM處檢測(cè)到了影響斷奶羊毛長(zhǎng)度的QTL；在86cM處檢測(cè)到了影響成年羊毛長(zhǎng)度的QTL；在85cM處檢測(cè)到了影響成年羊腹毛長(zhǎng)度重的QTL。在188家系57cM處檢測(cè)到了影響育成羊體重的QTL。在189家系在0cM處檢測(cè)到影響育成羊腹毛長(zhǎng)、育成羊剪毛量和羊毛直徑3個(gè)QTL，該位點(diǎn)與標(biāo)記ETH225連鎖。