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文檔簡介
1、纖維素是地球上含量最豐富的可再生物質(zhì),纖維素酶能夠?qū)⑵渌鉃槠咸烟牵瑸槭称泛湍茉刺峁┰?,然而目前的纖維素酶活力低、熱穩(wěn)定性差、成本高,其產(chǎn)業(yè)化應用受到嚴重制約,因此有必要對已有的纖維素酶進行改造,使其性能有所改善。本研究同時采用隨機突變和定點飽和突變的方法對臺灣家白蟻內(nèi)切葡聚糖酶CfEG進行了分子進化。
運用易錯PCR構(gòu)建隨機突變庫,篩選到兩株突變子K28E和F241L。K28E的最適pH比原始酶提高了0.5個單位,F(xiàn)2
2、41L的Tm值下降了近4℃。
采用半理性設(shè)計方法,在網(wǎng)站SWISS-MODEL以PDB數(shù)據(jù)庫中高山象白蟻內(nèi)切纖維素酶NtEG(PDB id=1Ks8)的三維結(jié)構(gòu)為模板,對CfEG進行三維結(jié)構(gòu)同源建模(二者氨基酸的同源性為79%)。比較同源建模預測的三維結(jié)構(gòu)和模板NtEG的三維結(jié)構(gòu),在此基礎(chǔ)上通過計算機輔助設(shè)計軟件ProSa2003,根據(jù)能量變化確定了CfEG活性中心內(nèi)的六個飽和突變位點D53、D56、E411、D122、R
3、360及Y407,其中D53、D56、E411分別與NtEG的催化殘基D54、D57、E412重合。對位點K28、F241也做了飽和突變以進一步篩選突變子,此外,根據(jù)多序列比對做了定點突變H305Y。
定點(飽和)突變庫共得到18個突變子。突變子D53E、D56C的羧甲基纖維素酶活提高了20%,疊加突變D53C/D56C、D53E/D56C則喪失了活力,雙突變子D53L/D56I、D53E/D56S的比活比原始酶分別提高了
4、近2倍和1.45倍。E411飽和突變子庫均沒有活性,進一步將其替換為近似氨基酸的E411D、E411Q定點突變子也喪失了酶活。由突變結(jié)果可推斷,位點E411為該酶行使功能的必需殘基。D122、K28、F241位點的突變子均酶活降低或失活,R360及Y407位點突變子的比活和野生酶相差不大。與野生酶相比,突變子D53E、D122C、D122E的酶活最適溫度下降了5℃;突變酶D56C的最適pH提高了1.5個單位,D53L/D56I、D122
5、C、R360K和K28E的最適pH提高了0.5個單位,Y407V和K28H的最適pH下降了0.5個單位;突變酶D53C、D56C的Tm值升高了4℃,D122C、D122E的Tm提高了約2℃,而Y407V、F241L的Tm值降低了近4℃。
本研究通過蛋白質(zhì)分子進化探索獲得新酶的有效途徑,通過分析比較獲得的突變酶的性質(zhì)變化,積累對工業(yè)用酶分子改造的經(jīng)驗,此外,對研究臺灣家白蟻內(nèi)切葡聚糖酶的結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系也具有非常重要的意義。
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