版權(quán)說明:本文檔由用戶提供并上傳,收益歸屬內(nèi)容提供方,若內(nèi)容存在侵權(quán),請進(jìn)行舉報(bào)或認(rèn)領(lǐng)
文檔簡介
1、淡水蚌類(雙殼綱:蚌目)廣泛分布于世界各地,是淡水生態(tài)系統(tǒng)中最重要的生物類群之一。中國長江中下游地區(qū)淡水蚌類種類繁多,主要基于貝殼形態(tài)學(xué)特征的種類鑒定使得一些蚌科物種的種名有效性仍存在爭議,屬及其以上階元的分類混亂。
雙殼綱中蚌目、貽貝目和簾蛤目的線粒體遺傳模式是特殊的雙重單親遺傳,存在父系和母系兩種高度分化并與性別相關(guān)的線粒體基因組,且兩種線粒體分布具有組織特異性?;诰€粒體基因組全序列的系統(tǒng)發(fā)育分析能夠增強(qiáng)系統(tǒng)樹的解析度和
2、數(shù)據(jù)置信度,適用于各階元的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系。
蟶蚌屬(Solenaia)是亞洲特有屬,中國目前能采集到活體樣本的蟶蚌有3種且均為中國特有種,分別是龍骨蟶蚌 S. carinatus、橄欖蟶蚌 S. oleivorus以及河蟶蚌 S. rivularis。因食用需求的大量捕撈,以及人類活動(dòng)導(dǎo)致的棲息地退化、改變和破碎化,蟶蚌屬物種的分布范圍日益狹窄、種群數(shù)量急劇下降。僅基于貝殼形態(tài)或解剖學(xué)特征,蟶蚌屬屬上單元分類仍具有爭議,相關(guān)遺傳
3、信息也少見報(bào)道。
本研究首次報(bào)道龍骨蟶蚌、橄欖蟶蚌以及河蟶蚌的父系與母系線粒體基因組全序列,其中所測定的父系線粒體全基因組為中國淡水蚌類中首次報(bào)道。結(jié)合 Genbank數(shù)據(jù)庫中其它淡水蚌類的線粒體基因組數(shù)據(jù),進(jìn)行比較基因組學(xué)分析。首次基于線粒體全基因組對蚌目進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育分析,以期為淡水蚌類的分類提供強(qiáng)有力的分子證據(jù),真實(shí)反映它們的親緣關(guān)系。主要研究結(jié)果如下:
1.使用 LA-PCR擴(kuò)增和步移法測序,拼接獲得中國特有三
4、種蟶蚌的父系與母系線粒體基因組全序列,6個(gè)線粒體基因組全長范圍從16392 bp到17550 bp不等。線粒體基因組大小的差異主要源于非編碼區(qū)長度的不同,此外,父系線粒體 cox2比母系線粒體 cox2要長~80%。
2.三種蟶蚌父系與母系線粒體的基因排列有較大差異,父系或母系線粒體基因組種間無任何基因重排。與 Genbank數(shù)據(jù)庫中其他淡水蚌類的線粒體全基因組比較,父系線粒體基因組均顯示出一致的基因順序,母系線粒體基因組則存
5、在重排現(xiàn)象。與除隆嵴蚌亞科(Gonideinae)外的蚌科(Unionidae)母系 mtDNA的基因順序相比,珍珠蚌科(Margaritiferidae)母系 mtDNA發(fā)生 trnE的移位。蟶蚌所隸屬的隆嵴蚌亞科母系 mtDNA與其他蚌科動(dòng)物的相比,cox2-rrnS區(qū)域因串聯(lián)重復(fù)隨機(jī)丟失發(fā)生了重排。cox2-rrnS區(qū)域的基因重排被認(rèn)為是隆嵴蚌亞科母系線粒體基因組水平的共同衍征,該區(qū)域內(nèi) nad2與 nad3相對排列位置變化這一母
6、系線粒體基因組特征可用來客觀準(zhǔn)確的判別一些貝殼形態(tài)上相似的屬種。
3.三種蟶蚌父系與母系線粒體基因組表現(xiàn)出顯著的序列差異,同種蟶蚌父系與母系線粒體基因組間核苷酸序列差異超過40%(pDnt),氨基酸序列差異超過47%(pDaa),均超過父系或母系 mtDNA種間差異。母系 mtDNA種間核苷酸與氨基酸差異均要小于父系 mtDNA種間的差異。單個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因方面,cox1最為保守,atp8最不保守,COX和 CYTB基因普遍比
7、要 NADH脫氫酶亞基基因保守。
4.基于淡水蚌類父系與母系線粒體全基因組,使用貝葉斯法和最大似然法構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹都獲得很高的數(shù)據(jù)置信度,結(jié)果表明:三種蟶蚌與尖鋤蚌、背瘤麗蚌、三角帆蚌、池蝶蚌以及日本的 Pronodularia japanensis親緣關(guān)系密切,都隸屬于隆嵴蚌亞科;父系與母系演化支互為單系群;父系比母系線粒體基因組有更快的進(jìn)化速率;支持蚌科中的珠蚌亞科、無齒蚌亞科、小方蚌亞科和隆嵴蚌亞科為單系群,系統(tǒng)發(fā)育樹
溫馨提示
- 1. 本站所有資源如無特殊說明,都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請下載最新的WinRAR軟件解壓。
- 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等,如果需要附件,請聯(lián)系上傳者。文件的所有權(quán)益歸上傳用戶所有。
- 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙,網(wǎng)頁內(nèi)容里面會(huì)有圖紙預(yù)覽,若沒有圖紙預(yù)覽就沒有圖紙。
- 4. 未經(jīng)權(quán)益所有人同意不得將文件中的內(nèi)容挪作商業(yè)或盈利用途。
- 5. 眾賞文庫僅提供信息存儲(chǔ)空間,僅對用戶上傳內(nèi)容的表現(xiàn)方式做保護(hù)處理,對用戶上傳分享的文檔內(nèi)容本身不做任何修改或編輯,并不能對任何下載內(nèi)容負(fù)責(zé)。
- 6. 下載文件中如有侵權(quán)或不適當(dāng)內(nèi)容,請與我們聯(lián)系,我們立即糾正。
- 7. 本站不保證下載資源的準(zhǔn)確性、安全性和完整性, 同時(shí)也不承擔(dān)用戶因使用這些下載資源對自己和他人造成任何形式的傷害或損失。
最新文檔
- 基于線粒體基因組的長蝽總科系統(tǒng)發(fā)育基因組學(xué)研究.pdf
- 基于線粒體基因組全序列的鱚屬魚類系統(tǒng)發(fā)育研究.pdf
- 池蝶蚌線粒體全基因組序列分析.pdf
- 基因、基因組和基因組學(xué)
- 我國藏族人群線粒體DNA系統(tǒng)發(fā)育基因組學(xué)研究.pdf
- 中國巨蚓科蚯蚓比較線粒體基因組學(xué)與分子系統(tǒng)發(fā)育研究.pdf
- 勞亞獸總目系統(tǒng)發(fā)育基因組學(xué)研究.pdf
- 麗蚌屬線粒體基因組雙單親遺傳研究與淡水蚌系統(tǒng)進(jìn)化分析.pdf
- 南方白甲魚線粒體基因組序列測定分析及白甲魚屬系統(tǒng)發(fā)育研究.pdf
- 幾種顎口線蟲線粒體基因組序列測定及系統(tǒng)發(fā)育研究.pdf
- 華南虎獅弓蛔蟲線粒體全基因組序列分析與系統(tǒng)發(fā)育研究.pdf
- 無參考基因組的比較基因組學(xué)研究.pdf
- 鱗翅目昆蟲線粒體全基因組結(jié)構(gòu)特點(diǎn)及其比較基因組學(xué)分析.pdf
- 基因組學(xué)題庫
- 幾種異尖科線蟲線粒體基因組序列測定及系統(tǒng)發(fā)育研究.pdf
- 10514.鱗翅目昆蟲的線粒體基因組與系統(tǒng)發(fā)育研究
- 捷蜥蜴線粒體基因組及有鱗目系統(tǒng)發(fā)育研究.pdf
- 10637.蘋果屬系統(tǒng)發(fā)育基因組學(xué)和生物地理學(xué)研究
- 11596.中國犬科動(dòng)物線粒體基因組研究及系統(tǒng)發(fā)育分析
- 9740.東海16種蝦虎魚類線粒體全基因組序列分析及系統(tǒng)發(fā)育研究
評(píng)論
0/150
提交評(píng)論