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文檔簡介
1、目的:甲狀腺乳頭狀癌(papillary thyroid carcinoma,PTC)的發(fā)病率快速上升,其中部分發(fā)生侵襲轉(zhuǎn)移者危險(xiǎn)度高、療效差。但其具體機(jī)制尚不清楚。本研究旨在篩選出與局部侵襲轉(zhuǎn)移的PTC相關(guān)lncRNA(long-noncoding RNA,lncRNA),為探討lncRNA參與侵襲轉(zhuǎn)移性PTC生物學(xué)過程提供實(shí)驗(yàn)依據(jù),以期進(jìn)一步闡明PTC轉(zhuǎn)移侵襲的分子機(jī)制。
方法:本研究利用lncRNA微矩陣基因芯片技術(shù)對(duì)局
2、部侵襲轉(zhuǎn)移性PTC進(jìn)行異常表達(dá)lncRNA篩選及進(jìn)一步分析。①將5例PTC組織和對(duì)應(yīng)的癌旁正常甲狀腺組織設(shè)為實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組,提取RNA進(jìn)行l(wèi)ncRNA芯片雜交和掃描,篩選出兩組間之間差異表達(dá)的lncRNA和mRNA(Fold Change,F(xiàn)>2,p<0.05)。②通過對(duì)差異表達(dá)的lncRNA和蛋白編碼基因進(jìn)一步行生物信息學(xué)功能分析,探討lncRNA在局部侵襲轉(zhuǎn)移性PTC中可能存在的作用機(jī)制。③通過預(yù)測lncRNA作為內(nèi)源競爭性RNA(
3、competing endogenous RNA,ceRNA)對(duì)靶基因的調(diào)控作用,結(jié)合文獻(xiàn)報(bào)道,證明lncRNA RP11-399O19.8,let-7a-5p與EphA4三者可能存在ceRNA關(guān)系。通過real time-PCR(RT-PCR)驗(yàn)證lncRNA RP11-399O19.8,let-7a-5p與EphA4三者之間在PTC中表達(dá)關(guān)系。
結(jié)果:lncRNA芯片技術(shù)檢測,發(fā)現(xiàn)338個(gè)lncRNA在PTC組織和癌旁正常
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