numerical ecology with r 數(shù)量生態(tài)學-r語言的應用

1、1 Numerical Ecology with R 數(shù)量生態(tài)學-R 語言的應用 Daniel Borcard Franç ois Gillet Pierre Legendre 著 賴江山 譯 高等教育出版社 3 3.3 Q 模式： 計算對象之間的距離矩陣 （Q Mode: Computing Distance Matrices Among Objects） 3.3.1 Q 模式：定量物種數(shù)據(jù) （Q Mode: Qu

2、antitative Species Data） 3.3.2 Q 模式： 二元 （有-無數(shù)據(jù)） 物種數(shù)據(jù) （Q Mode: Binary (Presence–Absence) Species Data） 3.3.3 Q 模式：定量數(shù)據(jù) (物種多度除外的數(shù)據(jù)) （Q Mode: Quantitative Data (Excluding Species Abundances) ） 3.3.4 Q 模式：二元數(shù)據(jù)（物種有-無除外的數(shù)據(jù)）（Q

3、Mode: Binary Data (Excluding Species Presence–Absence Data) ） 3.3.5 Q模式： 混合類型，包括等級 （定性多級） 變量 （ Q Mode: Mixed Types, Including Categorical (Qualitative Multiclass) Variables） 3.4 R 模式: 計算變量之間的依賴矩陣 （R Mode: Computing Depe

4、ndence Matrices Among Variables） 3.4.1 R 模式：物種多度數(shù)據(jù)（R Mode: Species Abundance Data） 3.4.2 R 模式：物種有-無數(shù)據(jù) （R Mode: Species Presence–Absence Data） 3.4.3 R 模式： 量化和序數(shù) （物種多度除外的數(shù)據(jù)） （R Mode: Quantitative and Ordinal Data(Other th

5、an Species Abundances) ） 3.4.4 R模式：二元數(shù)據(jù) （物種多度除外的數(shù)據(jù)） （R Mode: Binary Data (Other than Species Abundance Data) ） 3.5 物種數(shù)據(jù)的預轉(zhuǎn)化 （Pre-transformations for Species Data） 3.6 小結(jié)（Conclusion） 第4章 聚類分析 （Cluster Analysis） 4.1 目標 （O

6、bjectives） 4.2 聚類分析概述（Clustering Overview） 4.3 基于鏈接的層次聚類（Hierarchical Clustering Based on Links） 4.3.1 單鏈接聚合聚類（Single Linkage Agglomerative Clustering） 4.3.2 完全鏈接聚合聚類（Complete Linkage Agglomerative Clustering） 4.4 平均聚合聚類