天津地區(qū)嬰幼兒諾如病毒感染的分子流行病學(xué)特征.pdf

1、目的:
　　 1.研究2008年8月至2009年7月,天津地區(qū)嬰幼兒病毒性腹瀉中諾病毒。(Norovirus,Nv)的感染情況。
　　 2.初步研究天津地區(qū)諾如病毒優(yōu)勢(shì)流行株的分子生物學(xué)特性。
　　 3.初步探討諾如病毒感染的主要臨床特征,年齡及季節(jié)分布特征。
　　 4.比較用于檢測(cè)諾如病毒的兩對(duì)引物的檢出情況。
　　 方法:
　　 收集2008年8月至2009年7月天津兒童醫(yī)院門診腹瀉患

2、兒排除細(xì)菌性腹瀉糞便標(biāo)本。對(duì)收集的標(biāo)本采用免疫膠體金法檢測(cè)輪狀病毒,對(duì)輪狀病毒陰性標(biāo)本用試劑Trisol提取病毒總RNA后,采用針對(duì)諾如病毒的兩對(duì)特異引物(P289/P290和JV12Y/JV13I)進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)(RT-PCR)擴(kuò)增諾如病毒目的片段。并對(duì)部分諾如病毒陽(yáng)性標(biāo)本的PCR產(chǎn)物進(jìn)行測(cè)序。將測(cè)序結(jié)果在Genbank中進(jìn)行BLAST比較,使用Bioedit和DNAstar基因分析軟件,將所測(cè)病毒基因序列與Genbank中的

3、諾如病毒其它基因型及Genbank中的相近序列進(jìn)行核苷酸序同源性比較,并繪制基因進(jìn)化樹(shù)。同時(shí)收集患兒的腹瀉,嘔吐,發(fā)熱,糞便性狀等相關(guān)臨床資料。數(shù)據(jù)管理采用SPSS11.5進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,定性資料采用x2檢驗(yàn),定量資料采用t檢驗(yàn)。
　　 結(jié)果:
　　 1.天津地區(qū)2008年8月到2009年7月,在收集的540例糞便標(biāo)本中NV檢測(cè)為陽(yáng)性的標(biāo)本有174份,陽(yáng)性率為32.22％。
　　 2.測(cè)序的15株均屬于GⅡ-4型。

4、與世界NV流行趨勢(shì)相同。所測(cè)序列中,序列TJC0801與2006年北京的Beijing208株同源性最高；序列TJC0802,TJC0806與2006年的荷蘭Nijmegen115同源性最高；序列TJC0803與2007年韓國(guó)的Seou10534株同源性最高,序列TJC0804與2007年韓國(guó)的Seou10552,Seou10534同源性較高；序列TJC0805,TJC0901,TJC0902與2006年日本的Kumamoto5同源性較

5、高；序列TJC0807與2007年韓國(guó)的Seou10552株,Seou10545株,2006年深圳的Shenzhcn173-06株同源性較高；序列TJC0808與2007年北京的Beijing361株,Beijing310株同源性較高；序列TJC0809與2006年日本的Akital同源性較高；序列TJC0903,TJC0905與2007年北京的Beijing133株同源性較高；序列TJC0906與2007年的Beijing96株,Be

6、ijing10株同源性較高。除序列TJC0904外,其它14株核苷酸序列均于GⅡ-4/2006b相近,而TJC0904與2008年韓國(guó)Seou10229株同源性較高,為重組病毒。
　　 3.NV檢測(cè)陽(yáng)性的患兒中出現(xiàn)嘔吐的患兒為26例,占所有NV感染患兒的14.94％。發(fā)熱9例,占NV檢測(cè)陽(yáng)性患兒的5.17％。糞便性狀中蛋花樣糞便84例,占48.28％,稀糊樣糞便51例,占29.31％,稀水樣糞便39例,占22.41％。腹瀉平均持

7、續(xù)4.49天。在檢測(cè)的12個(gè)月中,2008年11月的檢出率最高,為62.22％,其次為2009年2月,檢出率為52.00％。2009年6月亦有小高峰,檢出率為39.62％。2008年8月檢出率最低,為12.50％。在NV檢測(cè)陽(yáng)性的患兒中,12.17月年齡組的患兒所占比例最高,為29.93％,其次為3-5月,9-11月年齡組,各占NV陽(yáng)性患兒的18.97％。2歲以下患兒占87.36％。在本次檢測(cè)中,男性患兒的檢出率為32.94％,女性患兒

8、的檢出率為31.00％。差別無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
　　 4.檢測(cè)NV的引物P289/290檢出率為21.33％,引物JV12Y/JV13I的檢出率為17.41％。二者差別有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
　　 結(jié)論:2008年8月至2009年7月,天津地區(qū)嬰幼兒病毒性腹瀉中,諾如病毒是主要的病原體之一。主要流行的基因型為GⅡ-4型。主要感染2歲以下的嬰幼兒。一年中各月均有NV陽(yáng)性標(biāo)本檢出,其中11月為發(fā)病高峰。引物P289/290對(duì)NV的檢出率