戎蘆科和景天屬植物的DNA條形碼通用序列研究.pdf

1、目的：評(píng)價(jià)幾個(gè)熱點(diǎn)DNA條形碼候選序列對(duì)葫蘆科、景天屬植物的鑒別能力。
　　 方法：使用ITS2、rbcL、matK和psbA-trnH序列的通用引物對(duì)葫蘆科、景天屬植物進(jìn)行PCR擴(kuò)增和測序，通過比較各序列的擴(kuò)增和測序成功率、種內(nèi)和種間的變異、barcoding gap，以及采取BLAST1和nearestDistance等方法評(píng)價(jià)不同序列的鑒定能力。
　　 結(jié)果：ITS2序列對(duì)葫蘆科33個(gè)屬，90個(gè)物種，182個(gè)樣本進(jìn)

2、行分析，其鑒定成功率較高，在屬水平為100.0％，在物種水平為88.5％；psbA-trnH序列對(duì)201個(gè)樣本進(jìn)行分析，其鑒定成功率在屬的水平為93.0％，在物種水平為73.1％，但它可以補(bǔ)充部分ITS2不能分析的物種區(qū)域。
　　 ITS2序列在采集的景天屬幾種藥用植物中擴(kuò)增成功率為100％，其種間與種內(nèi)變異差異顯著、barcoding gap較psbA-trnH、rbc1序列具有更明顯的優(yōu)勢，而且納入網(wǎng)上48個(gè)樣品33個(gè)種的數(shù)