嶗山奶山羊LEP、STAT5α基因多態(tài)性及與泌乳性狀和體尺性狀的關(guān)聯(lián)分析.pdf

1、泌乳性狀是奶山羊的重要經(jīng)濟(jì)性狀，但遺傳力低，常規(guī)育種方法使其遺傳進(jìn)展較緩慢，有必要借助標(biāo)記性輔助選擇(MAS)來提高奶山羊的選種準(zhǔn)確性和育種效率。
　　 為了探討LEP和STAT5a基因在嶗山奶山羊群體中的遺傳變異及其與生產(chǎn)性狀的關(guān)聯(lián)性，本研究以174只嶗山奶山羊泌乳母羊?yàn)閷?shí)驗(yàn)群體，利用DNA混池測(cè)序和候選基因直接測(cè)序技術(shù)檢測(cè)LEP基因外顯子2、外顯子3和STAT5a基因外顯子10、外顯子16在該群體中的多態(tài)性;用R軟件分析突變

2、位點(diǎn)的遺傳多態(tài)性;用SAS9.1軟件最小二乘法分析了多態(tài)性位點(diǎn)對(duì)生產(chǎn)性狀的關(guān)聯(lián)效應(yīng)。結(jié)果表明:
　　 (1) LEP基因外顯子2、3和STAT5a基因外顯子10、16上沒有發(fā)現(xiàn)類似于奶牛上與泌乳性能相關(guān)的突變位點(diǎn)。在LEP基因內(nèi)含子2上檢測(cè)到一個(gè)SNP，即L393突變位點(diǎn)的A/G單核苷酸替換，PIC(Polymorphism information content)值為0.3554，屬于中度多態(tài)(0.25＜PIC＜0.5)，P＜

3、0.05偏離哈代-溫伯格平衡;在STA T5a基因內(nèi)含子9上檢測(cè)到兩個(gè)SNP，即S163突變位點(diǎn)的A/G單核苷酸替換，S206突變位點(diǎn)的C/T單核苷酸替換，這兩個(gè)位點(diǎn)的基因型頻率和等位基因頻率均相同，為連鎖突變，PIC值為0.3310，屬于中度多態(tài)，P＞0.05處于哈代-溫伯格平衡。
　　 (2)在顯著性檢驗(yàn)時(shí)，對(duì)于乳成分，模型和場(chǎng)別效應(yīng)均達(dá)到顯著（P＜0.05）水平;三個(gè)SNP位點(diǎn)對(duì)乳成分的影響未達(dá)到顯著水平;場(chǎng)別與L393位

4、點(diǎn)、場(chǎng)別與S163/S206位點(diǎn)、L393與S163/S206位點(diǎn)的交互作用對(duì)乳成分的影響未達(dá)到顯著水平。L393位點(diǎn)對(duì)產(chǎn)奶量有顯著(P＜0.05)影響，L393與S163/S206位點(diǎn)的交互作用對(duì)產(chǎn)奶量的影響未達(dá)到顯著水平。
　　 對(duì)生長性狀而言，模型和場(chǎng)別效應(yīng)均達(dá)到顯著（P＜0.05）水平;S163/S206位點(diǎn)對(duì)體重、體長和胸圍有顯著（P＜0.05）影響;場(chǎng)與L393位點(diǎn)的交互作用對(duì)體高和尻寬有顯著（P＜0.05）或極顯著

5、(P＜0.01)的影響;場(chǎng)與S163/S206位點(diǎn)的交互作用對(duì)胸圍有顯著(P＜0.05)影響。S163/S206位點(diǎn)、場(chǎng)別與S163/S206位點(diǎn)的交互作用都對(duì)胸圍有顯著影響，但胸圍的場(chǎng)別效應(yīng)不顯著。
　　 (3)在與嶗山奶山羊泌乳性狀的關(guān)聯(lián)分析中，L393位點(diǎn)GG基因型個(gè)體的校正產(chǎn)奶量顯著（P＜0.05）高于AG和AA基因型個(gè)體。等位基因的效應(yīng)中，校正產(chǎn)奶量的加性效應(yīng)顯著（P＜0.05），替代效應(yīng)為極顯著(P＜0.01)的負(fù)值

6、，說明等位基因G是這個(gè)性狀的有利等位基因。
　　 (4)在與嶗山奶山羊生長性狀的關(guān)聯(lián)分析中，整個(gè)群體中，S163/S206位點(diǎn)GG/CC基因型個(gè)體的體重、體長顯著（P＜0.05）大于AA/TT基因型個(gè)體，等位基因的效應(yīng)中，體重、體長的加性效應(yīng)極顯著(P＜0.01)，替代效應(yīng)為顯著（P＜0.05）或極顯著(P＜0.01)負(fù)值，說明等位基因M/C為體重、體長性狀的有利等位基因。GG/CC、AG/CT基因型個(gè)體的胸圍顯著(P＜0.05

7、)大于AA/TT基因型個(gè)體，等位基因的效應(yīng)中，胸圍的加性效應(yīng)極顯著。(P＜0.01)，替代效應(yīng)為極顯著(P＜0.01)負(fù)值，說明等位基因G/C為胸圍的有利等位基因，顯性效應(yīng)不顯著。
　　 S163/S206位點(diǎn)在P群體中，GG/CC和AG/CT基因型個(gè)體胸圍極顯著(P＜0.01)大于AA/TT基因型個(gè)體。等位基因的效應(yīng)中，胸圍的加性效應(yīng)極顯著(P＜0.01)，替代效應(yīng)為極顯著(P＜0.01)負(fù)值，說明等位基因G/C為胸圍的有利等

8、位基因，顯性效應(yīng)不顯著。
　　 L393位點(diǎn)在F群體中，GG基因型個(gè)體的尻寬顯著（P＜0.05）高于AA基因型個(gè)體。等位基因的效應(yīng)中，尻寬的加性效應(yīng)顯著（P＜0.05），替代效應(yīng)為顯著(P＜0.05)負(fù)值，說明等位基因G為尻寬的有利等位基因。P群體中，AA和AG基因型個(gè)體的體高極顯著(P＜0.01)高GG基因型個(gè)體。等位基因的效應(yīng)中，體高的加性效應(yīng)極顯著(P＜0.01)，替代效應(yīng)為極顯著(P＜0.01)正值，說明等位基因A為體高