菜粉蝶顆粒體病毒的分子生物學(xué)研究.pdf_第1頁(yè)
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1、廣西大學(xué)博士學(xué)位論文菜粉蝶顆粒體病毒的分子生物學(xué)研究姓名:溫榮輝申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別:博士專業(yè):微生物學(xué)指導(dǎo)教師:陳保善20070101廣西大掌博士掌位論文菜粉蝴q頁(yè)糊吖拳病毒的分子生物掣u開(kāi)究組的物理圖譜。該物理圖譜與已報(bào)道的其他的PiraGV分離株的基因組物理圖譜比較,觀察到少量酶切位點(diǎn)的差異。PiraGVE3基因組中17個(gè)EcoRI位點(diǎn)中的14個(gè)與PiraGV英國(guó)分離株ArGVl基因組中19個(gè)EcoRI位點(diǎn)中的14個(gè)位點(diǎn)位置相一致,但Pi

2、raGVE3基因組中缺失了ArGVl另外的5個(gè)EcoRI位點(diǎn),同時(shí)在基因組其他位置增加了3個(gè)EcoRI位點(diǎn)。3PiraGVDNApolymerase(dnapoO基因的研究:PiraGVdnapol編碼框包含3135個(gè)核苷酸,編碼一個(gè)1045個(gè)氨基酸組成的預(yù)計(jì)分子量為12216kDa的蛋白質(zhì)。PiraGVdnapol基因與其他的桿狀病毒的dnapol基因有2870%的氨基酸同源性。與其他的桿狀病毒dnapol基因一樣,PiraGVdna

3、pol基因包含有保守的3’5’外切核酸酶的基序(motif)以及DNA結(jié)合功能域(domain)。Northern雜交顯示,在PiraGV感染的菜粉蝶幼蟲(chóng)體內(nèi),咖apol基因的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物主要為37kb的mRNA。5’和3’cDNA末端快速擴(kuò)增(RACE)顯示PiraGVdnapol基因的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物起使于翻譯起使密碼子ATG上游378的T,終止于一個(gè)poly(A)信號(hào)序列AATAAA。基于dnapol基因的系統(tǒng)進(jìn)化分析顯示PiraGV與蘋果小

4、卷葉蛾顆粒體病毒(CydiapomonellaGV,CpGV),云杉卷葉蛾顆粒體病毒(ChoristoneuraoccidentalisGV,ChocGV)和蘋果異形小卷蛾顆粒體病毒(CryptophlebialeucotretaGV,CrleGV)在進(jìn)化關(guān)系上最為密切。4PiraGV的全基因組測(cè)序:PiraGV基因組全長(zhǎng)108476bp,堿基組成中AT含量為668%,預(yù)測(cè)PiraGV基因組含有125個(gè)orf(;,150nt),其中29

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