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文檔簡介
1、分子生物學(xué)基本技術(shù),講授內(nèi)容,一、分子雜交與印記技術(shù)二、PCR技術(shù)三、基因文庫四、DNA測序技術(shù)五、芯片技術(shù)六、蛋白質(zhì)相互作用研究,一、分子雜交與印跡技術(shù)Molecular Hybridization & Blotting Technology,核酸分子雜交 (nucleic acid hybridization ) 在DNA復(fù)性過程中,如果把不同DNA單鏈分子放在同一溶液中,或把DNA與RNA放在一起,只要在DN
2、A或RNA的單鏈分子之間有一定的堿基配對關(guān)系,就可以在不同的分子之間形成雜化雙鏈(heteroduplex) 。,一、基本原理,(一)印跡技術(shù)(二)探針技術(shù),探針 (probe) 一小段用同位素、生物素或熒光染料標標記其末端或全鏈的已知序列的多聚核苷酸,與固定在NC膜上的核苷酸結(jié)合,判斷是否有同源的核酸分子存在。,二、印跡技術(shù)的類別及應(yīng)用,(一)DNA印跡技術(shù) (Southern blotting) 用于基因組DNA、重組質(zhì)粒
3、和噬菌體的分析。,(二)RNA印跡技術(shù) (Northern blotting) 用于RNA的定性定量分析。,(三)蛋白質(zhì)的印跡分析 (Western blotting) 用于蛋白質(zhì)定性定量及相互作用研究。,三種印跡技術(shù)的比較,放射自顯影照片,其他雜交技術(shù):斑點印跡 (dot blotting) 原位雜交 (in situ hybridization)DNA點陣 (DNA array) DNA芯片技術(shù)
4、 (DNA chip),斑點雜交(dot blotting),將RNA或DNA變性后直接點樣于硝酸纖維素膜或尼龍膜上,用于基因組中特定基因及其表達產(chǎn)物的定性及定量的研究。,反向斑點雜交(reverse dot blotting),先將探針固定于硝酸纖維素膜或尼龍膜上,將樣品RNA或DNA標記變性后進行雜交。改變了傳統(tǒng)雜交方法中一次雜交只能檢測一種樣品的局限,大大提高了基因診斷的效率。,13,原位分子雜交技術(shù),原位雜交(in situ
5、hybridization,ISH)即利用分子雜交技術(shù)來進行基因及其表達產(chǎn)物定位分析的一種技術(shù);可用于基因及其表達產(chǎn)物的定位分析。,熒光原位雜交(FISH),DNA點陣,二、聚 合 酶 鏈 反 應(yīng) Polymerase Chain Reaction,,5?,Primer 1,,5?,Primer 2,,,,5?,5?,Template DNA,,,,,,一、基本原理,,,,,,,,,模板DNA 特異性引物耐熱DNA聚
6、合酶 dNTPs Mg2+,二、PCR體系基本組成成分,三、PCR的基本反應(yīng)步驟,變性95?C,延伸72?C,退火Tm-5?C,,,,,(一)目的基因的克?。ǘ┗虻捏w外突變(三)DNA和RNA的微量分析(四)DNA序列測定(五)基因突變分析,四、PCR的主要用途,三、幾種重要的PCR衍生技術(shù),(一)反轉(zhuǎn)錄PCR技術(shù)(二)原位PCR技術(shù)(三)實時PCR技術(shù),實時PCR技術(shù)原理,三、基 因 文 庫
7、 Gene Library,基因組DNA文庫 (genomic DNA library)cDNA文庫 (cDNA library),基因文庫 (gene library),是指一個包含了某一生物體全部DNA序列的克隆群體。,基因組DNA文庫,第一輪篩選,第二輪篩選,第三輪篩選,基因組文庫篩選結(jié)果舉例,四、DNA序列測定分析 Nucleic Acid Sequence Analysis,一、DNA鏈末端合成終止法,二
8、、DNA自動測序,采用熒光替代放射性核素標記是實現(xiàn)DNA序列分析自動化的基礎(chǔ)。用不同熒光分子標記四種雙脫氧核苷酸,然后進行Sanger測序反應(yīng),反應(yīng)產(chǎn)物經(jīng)電泳(平板電泳或毛細管電泳)分離后,通過四種激光激發(fā)不同大小DNA片段上的熒光分子使之發(fā)射出四種不同波長熒光,檢測器采集熒光信號,并依此確定DNA堿基的排列順序。,DNA自動測序結(jié)果舉例,五、芯片分析技術(shù),Biological Chip Technology,DNA芯片(DNA chi
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