蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)預(yù)測的信息統(tǒng)計(jì)迭代比對算法.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、信息統(tǒng)計(jì)迭代算法(ISIA)是一種全新的從蛋白質(zhì)氨基酸序列出發(fā)預(yù)測二級結(jié)構(gòu)序列的算法。此算法可以很好的揭示氨基酸序列和二級結(jié)構(gòu)序列之間的內(nèi)在關(guān)系，進(jìn)而對蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)做出預(yù)測。在傳統(tǒng)的貝葉斯方法基礎(chǔ)上，信息統(tǒng)計(jì)迭代算法采用了3個(gè)不同的閾值去提高預(yù)測的準(zhǔn)確率。 信息統(tǒng)計(jì)迭代比對算法(ISIA-MSA)是在利用多重序列比對的進(jìn)化信息的基礎(chǔ)上，有機(jī)的結(jié)合信息統(tǒng)計(jì)迭代算法的一種預(yù)測蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)的混合型算法。對序列進(jìn)行比對，并利用序列

2、比對的信息進(jìn)行結(jié)構(gòu)的預(yù)測。在比對的過程中，我們可以找到和未知序列相似的序列家族，然后假設(shè)序列家族中的同源區(qū)有同樣的二級結(jié)構(gòu)，預(yù)測不是基于一個(gè)序列而是一組序列中的所有序列的一致序列。信息統(tǒng)計(jì)迭代比對算法(ISIA-MSA)綜合利用了序列的進(jìn)化信息和統(tǒng)計(jì)信息。 以PDBselect數(shù)據(jù)庫中的提取的3265條蛋白質(zhì)肽鏈作為實(shí)驗(yàn)的數(shù)據(jù)庫。信息統(tǒng)計(jì)迭代算法的預(yù)測準(zhǔn)確率為Q<,3>：62.5％。而信息統(tǒng)計(jì)迭代比對算法的預(yù)測結(jié)果在經(jīng)過完整的

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