11微生物的分類及其分類方法

1、河北北方學院食品微生物學講稿1第三章第三章微生物的分類及其分類方法微生物的分類及其分類方法本章的核心內(nèi)容是微生物的分類單元、微生物的命名法則；目前國內(nèi)外最權威的原核微生物分類系統(tǒng)；用于分離菌株分類鑒定的方法和技術；微生物菌種的保藏。微生物的分類單元有界、門、綱、目、科、屬、種；微生物的命名依林奈氏雙名法法則進行；《伯杰氏細菌學鑒定手冊》，《伯杰氏系統(tǒng)細菌學手冊》是當今進行細菌鑒定的最權威的手冊；微生物分離菌株的分類鑒定有經(jīng)典分類鑒定法、

2、數(shù)值分類鑒定法、化學分類鑒定法、遺傳學分類鑒定法，DNA中GCmol%分析、DNADNA雜交、DNArRNA雜交、16SrRNA(16SrDNA)寡核苷酸的序列分析，微生物系統(tǒng)發(fā)育地位分析等不同層次的技術方法。微生物菌種的保藏對于研究和發(fā)酵生產(chǎn)都具有不可忽視的意義。保藏方法可依不同條件選擇不同方法。第一節(jié)第一節(jié)微生物的分類單元和命名微生物的分類單元和命名分類是人類認識微生物，進而利用和改造微生物的一種手段，微生物工作者只有在掌握了分類學

3、知識的基礎上，才能對紛繁的微生物類群有一清晰的輪廊，了解其親緣關系與演化關系，為人類開發(fā)利用微生物資源提供依據(jù)。微生物分類學(microbialtaxonomy)是一門按微生物的親緣關系把它們安排成條理清楚的各種分類單元或分類群(taxon)的科學，它的具體任務有三，即分類(classification)、命名(nomenclature)和鑒定(identification)。分類指的是根據(jù)相似性或親緣關系，將一個有機體放在一個單元中。

4、命名是按照國際命名法規(guī)給有機體一個科學名稱。鑒定則是確定一個新的分離物是否歸屬于已經(jīng)命名的分類單元的過程。因此，概括來說，微生物分類學是對各個微生物進行鑒定，按分類學準則排列成分類系統(tǒng)，并對已確定的分類單元進行科學命名的科學。一、微生物的分類單元一、微生物的分類單元微生物的主要分類單位，依次為界(kingdom)、門（phylum或division）、綱(class)、目(der)、科(fami1y)、屬(genus)、種(specie

5、s)。其中種是最基本的分類單位。具有完全或極多相同特點的有機體構成同種。性質(zhì)相似、相互有關的各種組成屬。相近似的屆合并為科。近似的科合并為目。近似的目歸納為綱。綜合各綱成為門。由此構成一個完整的分類系統(tǒng)。以下以檸檬浮霉狀菌為例加以說明。河北北方學院食品微生物學講稿3菌株或品系菌株或品系(strain)這是微生物學中常碰到的一個名詞，它主要是指同種微生物不同來源的純培養(yǎng)物。從自然界分離純化所得到的純培養(yǎng)的后代，經(jīng)過鑒定屬于某個種，但由于來

6、自不同的地區(qū)、土壤和其他生活環(huán)境，它們總會出現(xiàn)一些細微的差異。這些單個分離物的純培養(yǎng)的后代稱為菌株。菌株常以數(shù)目、字母、人名或地名表示。那些得到分離純化而未經(jīng)鑒定的純培養(yǎng)的后代則稱為分離物。微生物學中還常常用到“群”這個詞，這只是為了科研或鑒定工作方便，首先按其形態(tài)或結合少量的生理生化、生態(tài)學特征，將近似的種和介于種間的菌株歸納為若干個類群。如為了篩選抗生素工作的方便，中國科學院微生物研究所根據(jù)形態(tài)和培養(yǎng)特征，把放線菌中的鏈霉菌屬歸納為

7、12個類群。微生物分類各級單元所用的后綴如表31。表3－1微生物分類各級單元拉丁學名后綴二、微生物的命名二、微生物的命名微生物的命名和其他生物一樣，都按國際命名法命名，即采用林奈氏(Linnaeus)所創(chuàng)立的“雙名法”。每一種微生物的學名都依屬與種而命名，由兩個拉丁字或希臘字或者拉丁化了的其他文字組成。屬名在前，規(guī)定用拉丁字名詞表示，字首字母要大寫，由微生物的構造、形狀，或由著名的科學家名字而來，用以描述微生物的主要特征。種名在后，用拉