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文檔簡介
1、擬穴青蟹是我國沿海重要的經(jīng)濟(jì)蟹類,具有很高的商品經(jīng)濟(jì)價值,由于海域污染和人為過度捕撈等原因,導(dǎo)致資源量受到嚴(yán)重破壞。本研究采用磁珠富集法,開發(fā)了擬穴青蟹高多態(tài)微衛(wèi)星引物8對,并應(yīng)用微衛(wèi)星分子標(biāo)記技術(shù)對擬穴青蟹群體進(jìn)行遺傳多樣性和遺傳分化研究,以期為我國擬穴青蟹種質(zhì)資源的可持續(xù)利用及保護(hù)、加快良種選育提供科學(xué)依據(jù)。
1.采用磁珠富集法,利用生物素標(biāo)記的(GT)15、(CT)15混合寡核苷酸探針從擬穴青蟹的基因組DNA的Mse1I
2、酶切片段中篩選500~1200bp的微衛(wèi)星序列。將洗脫的雜交片段克隆到pMD18-T載體上構(gòu)建富集微衛(wèi)星基因組文庫,通過PCR篩選檢測出陽性克隆進(jìn)行測序。挑取350個克隆檢測,取130個片段大小為≥500bp克隆測序,從中設(shè)計了48對引物。以海南瓊山擬穴青蟹群體為研究對象,對引物進(jìn)行多態(tài)性檢測,共檢測出8對高多態(tài)引物,其等位基因數(shù)為2~8個,多態(tài)信息含量為0.239~0.841,觀察雜合度為0.3333~0.667,期望雜合度為0.27
3、78~0.8589。多態(tài)性分析結(jié)果顯示,8對引物均具有較高的多態(tài)性,適合進(jìn)行種群遺傳學(xué)研究。
2.采用8對微衛(wèi)星引物,對我國沿海擬穴青蟹10個野生群體的遺傳結(jié)構(gòu)進(jìn)行研究,分析了各群體內(nèi)的遺傳多樣性和10個群體間的遺傳分化。擬穴青蟹10個群體平均每位點等位基因數(shù)(A)介于3.6250~4.5000之間,平均為4.1111;平均每位點有效等位基因數(shù)(Ae)介于2.3550~2.9611之間,平均為2.6818;多態(tài)信息含量(PIC
4、)介于0.4497~0.542之間,平均為0.4971;觀察雜合度在0.3228~0.4859之間,平均為0.4215;期望雜合度在0.5042~0.6092之間,平均為0.5492。表明擬穴青蟹群體遺傳多樣性處于中等水平。群體間遺傳距離(D)介于0.011~0.1983之間,遺傳分化系數(shù)(FST)為0.0411,表明擬穴青蟹10個群體之間分化較弱。聚類分析顯示,海南四個群體遺傳距離較近先聚為一類,再與福建群體、廣東群體聚為一類,最后與
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