大菱鲆引進(jìn)不同地理群體遺傳多樣性分析及微衛(wèi)星標(biāo)記的開發(fā).pdf

1、1.本文利用12個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)對(duì)大菱鲆(Scophthalmus maximusL.)四個(gè)引進(jìn)地理群體進(jìn)行遺傳多樣性分析。結(jié)果表明，等位基因數(shù)(A)為2～10個(gè)，平均等位基因數(shù)為4.3，有效等位基因數(shù)(Ne)為1.6～6.1，平均有效等位基因數(shù)2.7，各位點(diǎn)的雜合度期望值(He)為0.3823～0.8416。各群體之間無偏倚雜合度期望值由小到大依次為丹麥群體、英國(guó)群體、法國(guó)群體、挪威群體，運(yùn)用SPSS軟件對(duì)無偏倚雜合度期望值進(jìn)行Krusk

2、al-Wallis檢驗(yàn)，結(jié)果（H=4.438，df=3,P=0.218）顯示四個(gè)地理群體的遺傳多樣性差異不顯著。群體間平均遺傳分化指數(shù)(Fst)為0.1117，各群體之間存在中度遺傳分化。用UPGMA法進(jìn)行聚類分析，四個(gè)地理群體聚為兩類，挪威群體和丹麥群體聚為一類，法國(guó)群體和英國(guó)群體聚為一類。結(jié)合Hardy-Weinberg平衡和遺傳偏離指數(shù)(d)，四個(gè)群體都不同程度的偏離平衡。四個(gè)群體具有一定的遺傳分化，較好的遺傳多樣性，適合作為大規(guī)

3、模家系選育的基礎(chǔ)群體。
　　 2.文章利用FIASCO(Fast Isolation by AFLP of Sequences Containing repeats)法構(gòu)建了大菱鲆的微衛(wèi)星DNA富集文庫，檢測(cè)結(jié)果證明該微衛(wèi)星DNA文庫的富集效率在39％左右。測(cè)序分析得知有101條克隆含有微衛(wèi)星DNA序列，共得到125個(gè)微衛(wèi)星DNA位點(diǎn)。其中完美型為92個(gè)，占73.6％；非完美型為27個(gè)，占21.6％；復(fù)合型6個(gè)，占4.8％。所得

4、到的微衛(wèi)星DNA的重復(fù)次數(shù)在5～96次之間，核心序列重復(fù)次數(shù)5～9次的占36.8％，重復(fù)次數(shù)10～19次的占35.2％平均重復(fù)次數(shù)為16.7。對(duì)所篩大菱鲆微衛(wèi)星DNA重復(fù)類型所占百分比的統(tǒng)計(jì)，重復(fù)類型最多的是(CA/GT)n占75％，其次是(CT/GA)n占16％，其余重復(fù)類型占的比重較小。結(jié)果顯示該方法可以較好的應(yīng)用于大菱鲆微衛(wèi)星DNA位點(diǎn)的分離。這些微衛(wèi)星DNA標(biāo)記的獲得將為大菱鲆遺傳多樣性分析、遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建及分子標(biāo)記輔助育種

5、奠定良好的基礎(chǔ)。
　　 根據(jù)分離所到大菱鲆微衛(wèi)星DNA位點(diǎn)，設(shè)計(jì)了85對(duì)引物，其中有56對(duì)能夠得到穩(wěn)定表達(dá)的產(chǎn)物。利用從四個(gè)不同地理群體隨機(jī)取得的30條的大菱鲆進(jìn)行遺傳多樣性檢測(cè)結(jié)果有45對(duì)表現(xiàn)出多態(tài)性。這45個(gè)位點(diǎn)的等位基因數(shù)為2～19平均等位基因數(shù)為6.24，有效等位基因數(shù)為1.30～11.11平均值為3.66。期望雜合度為0.235～0.9254。多態(tài)信息含量為0.2044～0.9033平均值為0.622。45個(gè)多態(tài)性的位