三個(gè)地區(qū)根際土壤可培養(yǎng)原核微生物多樣性的研究.pdf

1、本文采用純培養(yǎng)方法，結(jié)合樣品所在地環(huán)境生態(tài)特征，設(shè)計(jì)不同分離培養(yǎng)基，建立適合河南云臺(tái)山、云南騰沖和越南下龍灣地區(qū)三個(gè)地區(qū)原核微生物純培養(yǎng)分離技術(shù)，并對(duì)這三個(gè)地區(qū)的原核微生物的群落多樣性進(jìn)行了研究。本研究設(shè)計(jì)了10種分離培養(yǎng)基，從上述三個(gè)地區(qū)土壤中分離到了大量細(xì)菌和放線菌，并將之分離、純化與保藏。將分離純化的細(xì)菌和放線菌進(jìn)行16S rRNA基因擴(kuò)增并測(cè)序，通過(guò)序列比對(duì)、系統(tǒng)發(fā)育分析等手段對(duì)分離到的原核微生物進(jìn)行多樣性分析，探討三個(gè)地區(qū)微生

2、物多樣性分布特點(diǎn)，確定候選新屬與新種，并比較分析三個(gè)地區(qū)原核微生物群落組成特點(diǎn)及物種相似性。
　　從云臺(tái)山地區(qū)土壤樣品中共分離和保存了258株純培養(yǎng)物，其中84株已經(jīng)測(cè)序，通過(guò)序列比對(duì)顯示這些菌株分布于6個(gè)目，12個(gè)科，17個(gè)屬中，并分離到1個(gè)潛在新種。此次共分離到芽孢桿菌34株，與芽孢菌屬(Bacillus)的9個(gè)種有最近的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系，占該地區(qū)已測(cè)序菌株的41.46％;其次是節(jié)桿菌，共17株，與節(jié)桿菌屬(Arthrobacte

3、r)的8個(gè)種有最近的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系，占該地區(qū)已測(cè)序菌株的20.73％。此地區(qū)原核微生物多樣性指數(shù)分別為:Shannon-Wienner多樣性指數(shù)H'=4.664;Simpson指數(shù)D=0.914;Margalef物種豐富度指數(shù)dMa=9.705;Shannon物種均勻度指數(shù)E=1.232。
　　騰沖地區(qū)分離的280株純培養(yǎng)物中已測(cè)序151株，序列比對(duì)顯示這些菌株分布于8個(gè)目，21個(gè)科，32個(gè)屬中，并且有2個(gè)候選新屬和4個(gè)候選新種。此

4、次共分離到鏈霉菌31株，與鏈霉菌屬的12個(gè)種有最近的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系，占該地區(qū)已測(cè)序菌株的20.53％;其次是芽孢桿菌，共分離到22株，與芽孢桿菌屬的5個(gè)種有最近的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系，占該地區(qū)已測(cè)序菌株的14.57％。此地區(qū)原核微生物多樣性指數(shù)分別為:Shannon-Wienner多樣性指數(shù)H'=5.678;Simpson指數(shù)D=0.971;Margalef物種豐富度指數(shù)dMa=14.55;Shannon物種均勻度指數(shù)E=1.320。
　　

5、在下龍灣地區(qū)共分離和保存499株菌株，其中的266株已經(jīng)測(cè)序，序列比對(duì)顯示這些菌株分布于12個(gè)目，29個(gè)科，54個(gè)屬，并分離到5個(gè)候選新種，1個(gè)候選新屬。此次共分離到芽孢桿菌25株，與芽孢菌屬(Bacillus)的14個(gè)種有最近的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系，占該地區(qū)已測(cè)序菌株的9.4％;其次是鏈霉菌，共19株，與鏈霉菌屬（Streptomyces）的13個(gè)種有最近的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系，占該地區(qū)已測(cè)序菌株的7.14％。此地區(qū)原核微生物多樣性指數(shù)分別為:Sha

6、nnon-Wienner多樣性指數(shù)H'=6.970;Simpson指數(shù)D=0.987;Margalef物種豐富度指數(shù)dMa=27.40;Shannon物種均勻度指數(shù)E=1.384。
　　以上結(jié)果表明，在下龍灣地區(qū)存在著豐富多樣的原核微生物，而云臺(tái)山地區(qū)原核微生物的物種較為單一。通過(guò)計(jì)算這三個(gè)地區(qū)兩兩之間的Jaccard相似性指數(shù)可以看出，云臺(tái)山地區(qū)和下龍灣地區(qū)之間原核微生物物種相似性為3.12％，云臺(tái)山地區(qū)和騰沖地區(qū)之間為4.42