4個不同世代凡納濱對蝦群體AFLP和ITS-1分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、為評估目前國內凡納濱對蝦苗種的遺傳變異情況,本文以引進美國佛羅里達州邁阿密SPF凡納濱對蝦(Litopenaeus vannamei)親本(QB)、F1、F2代,及由在中國養(yǎng)殖多代的凡納濱對蝦為親本培育的Fn代為試驗對象,通過AFLP標記技術和ITS-1序列對4個群體進行遺傳多樣性分析,為我國凡納濱對蝦的健康養(yǎng)殖和進一步進行良種選育,建立凡納濱對蝦良種繁育體系提供參考依據(jù),以促進我國的對蝦養(yǎng)殖業(yè)的健康發(fā)展。1.利用AFLP對4個不同世代

2、的凡納濱對蝦群體進行遺傳分析,探討親本、F1代、F2代和Fn代4個世代群體間的遺傳差異。選取10對AFLP引物組合對4個世代凡納濱對蝦群體共80尾個體進行比較分析,共擴增出483個位點,其中348個為多態(tài)位點;4代群體的多態(tài)位點比例為:61.90%、49.28%、50.52%、46.38%;4代群體的Shannon多樣性指數(shù)分別為:0.3134、0.2621、0.2594、0.2262;結果表明QB與F1代,F(xiàn)2代與Fn代相互間遺傳距離

3、更為緊密。2.對凡納濱對蝦ITS-1序列進行了克隆測序,并對ITS-1序列進行了分析,結果顯示,凡納濱對蝦ITS-1序列長度為614bp,已登錄GenBank數(shù)據(jù)庫,登錄號為GQ392035。與從GenBank中檢索到的8種對蝦的ITS-1序列比較顯示,相似性在39.29%-71.84%之間;根據(jù)凡納濱對蝦與其他9種對蝦ITS-1序列的同源性構建進化樹,得出了凡納濱對蝦與細角濱對蝦、南方濱對蝦、白濱對蝦的關系更為接近。利用AMOVA軟件

4、對四個不同世代的32尾凡納濱對蝦進行遺傳多樣性分析,結果顯示QB與F1代,F(xiàn)2代與Fn代更為接近。利用最小自由能對32尾凡納濱對蝦ITS-1序列進行二級結構預測,結果為QB有1個特殊結構,F(xiàn)1有1個,F(xiàn)2有3個,F(xiàn)n有3個。除QB的特殊結構外,其余的特殊結構主要是由于ITS-1序列前約200個堿基中(GCA)n、(GCC)n和(GCGA)n三種微衛(wèi)星數(shù)目的差異所造成的。
   本試驗結果發(fā)現(xiàn)進口親本與F1代的親緣關系更為接近,而

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