浙東白鵝和朗德鵝MC1R基因變異與定量表達(dá)研究.pdf

1、毛色/羽色是一種可利用的經(jīng)濟(jì)性狀和遺傳標(biāo)記，它在確定品種純度、雜交組合和親緣關(guān)系方面具有重要作用。黑素皮質(zhì)素受體1（Melanocortin1 Receptor, MC1R）基因變異與許多脊椎動(dòng)物（包括一些鳥類）的毛色/羽色表型相關(guān)，是毛色/羽色遺傳的重要候選基因。本研究以MC1R基因?yàn)檠芯繉?duì)象，采用PCR產(chǎn)物直接測(cè)序的方法，對(duì)朗德鵝灰羽和花羽（灰白相間）、浙東白鵝白羽3個(gè)羽色系MC1R基因的部分編碼區(qū)進(jìn)行了單核苷酸多態(tài)性（Single

2、NucleotidePolymorphism,SNP）篩查和遺傳多樣性分析，并通過熒光定量PCR技術(shù)，分析MC1R基因在1d、14d、21d、28d、42d和56d六個(gè)時(shí)間點(diǎn)品種間的表達(dá)差異和在皮膚組織中不同時(shí)間點(diǎn)的發(fā)育性變化，以探討MC1R基因變異對(duì)浙東白鵝和朗德鵝羽色遺傳的影響，從而為遺傳育種研究提供分子生物學(xué)依據(jù)。
　　 本試驗(yàn)擴(kuò)增了浙東白鵝和朗德鵝MC1R基因編碼區(qū)的714bp。通過生物信息學(xué)分析，發(fā)現(xiàn)A+T含量為40.

3、20％，G+C含量為59.52％，A+T含量遠(yuǎn)低于G+C含量。浙東白鵝與朗德鵝MC1R基因與GenBank中其它雁屬M(fèi)C1R基因的核苷酸同源性高達(dá)99％以上。
　　 通過對(duì)SNP位點(diǎn)的篩選，在所有群體中共篩查到5個(gè)SNPs，即210C＞T、321C＞T、411C＞T、525C＞T、756G＞A，且都為簡(jiǎn)約信息位點(diǎn)。其中210C＞T、321C＞T、756G＞A3個(gè)突變位點(diǎn)只存在于浙東白鵝中，411C＞T、525C＞T2個(gè)突變位點(diǎn)只

4、存在于朗德鵝中，經(jīng)過與GenBank中已提交的鵝的MC1R基因序列比對(duì)，發(fā)現(xiàn)這5個(gè)SNPs都是在浙東白鵝和朗德鵝中新發(fā)現(xiàn)的SNPs。將核苷酸序列翻譯后發(fā)現(xiàn)，這5個(gè)突變位點(diǎn)并未引起氨基酸序列的改變，均為同義突變。用Phase軟件進(jìn)行分型，共分出7種單倍型，其中單倍型Z2(C-C-C-C-G)和Z4(C-C-T-C-G)為優(yōu)勢(shì)單倍型，Z2Z2和Z4Z4單倍型組合為優(yōu)勢(shì)單倍型組合。經(jīng)卡方獨(dú)立性檢驗(yàn)，這5個(gè)突變位點(diǎn)不同基因型和單倍型在鵝品種間和

5、羽色性狀間的分布差異都達(dá)到了極顯著水平的水平，表明MC1R基因?qū)Z的羽色性狀有著重要影響，說明MC1R基因是鵝羽色的主要候選基因。
　　 本研究采用熒光定量PCR技術(shù)檢測(cè)了MC1R基因mRNA水平表達(dá)情況，結(jié)果表明，MC1R基因在浙東白鵝1d皮膚組織中的表達(dá)量最高，而在朗德鵝中卻是在28d皮膚組織中表達(dá)量最高。對(duì)于同一時(shí)間點(diǎn)，除1d和21d外，其余時(shí)間點(diǎn)浙東白鵝和朗德鵝品種間的表達(dá)差異均達(dá)到了顯著或極顯著的水平。對(duì)于同一品種不同