遼寧省東北林蛙遺傳多樣性與環(huán)渤海地區(qū)林蛙系統(tǒng)發(fā)育研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、運用RAPD分子標記方法,對分布于遼寧省的4個東北林蛙種群的遺傳多樣性進行研究,以揭示遼寧省東北林蛙的遺傳多樣性水平、遺傳變異和遺傳結構,進而探討東北林蛙種群間的遺傳分化程度及其與其生境的關系,為合理利用東北林蛙資源提供科學的依據(jù)。通過對環(huán)渤海地區(qū)分布的林蛙線粒體16S rRNA基因序列分析,采用多種方法對其系統(tǒng)發(fā)育關系進行分析,探討本地區(qū)林蛙動物的系統(tǒng)進化關系和演化機制,以期為從分子生物地理學角度探索環(huán)渤海地理形成及變化的過程提供幫助

2、。
   一、從遼寧省桓仁、撫順、本溪和阜新采集到4個自然種群的東北林蛙,通過RAPD分子標記,研究了東北林蛙的遺傳多樣性和遺傳分化。主要分析了種群間的等位基因頻率、多態(tài)條帶百分率(PPL)、基因多樣度(h)、基因分化系數(shù)(Gst)和Shannon多樣指數(shù)等遺傳參數(shù),用非加權平均法構建系統(tǒng)樹,并通過分子變異分析(AMOVA)來探討遺傳變異在個體、種群和地理區(qū)域等不同階層中的分布格局。研究結果如下:
   (1)從23個隨

3、機引物中篩選出9個重復性好、多態(tài)性高的引物,對110個東北林蛙樣本基因組DNA進行擴增,每個引物擴增出7-13個明顯的片斷,共檢出95條帶,全部表現(xiàn)出多態(tài)性,多態(tài)百分率100%。Shnnaon多樣指數(shù)(I=0.1596)及Nei基因多樣性指數(shù)(h=0.0821)均顯示東北林蛙遺傳變異程度比較低,遺傳多樣性相對缺乏。表現(xiàn)最為豐富的桓仁地區(qū),Shannon多樣指數(shù)也僅為0.2337,基因多樣性指數(shù)為0.1341。
   (2)4個地

4、理種群間基因分化系數(shù)(Gst=0.0231)較低,而群體之間每代遷移數(shù)很大(Nm=9.0219),說明各群體間基因交流比較多,群體之間無顯著遺傳分化。在基因多樣性測度中,群體內(nèi)基因多樣性(Hs=0.0753)在總基因多樣性(Ht=0.0771)中所占比例為97%。分子變異分析(AMOVA)結果,遺傳變異主要來自于種群內(nèi)(Fst=0.1210)。
   二、分析了6種林蛙30個樣本的線粒體16S rRNA基因序列,結合已經(jīng)發(fā)表的鎮(zhèn)

5、海林蛙和日本林蛙的同源序列,探討了環(huán)渤海地區(qū)林蛙群的系統(tǒng)發(fā)育關系和生物地理演化。用鄰接法(NJ)、最大簡約法(MP)、最大似然法(ML)和貝葉斯推論(BI)構建了系統(tǒng)發(fā)育樹。以基于Hierarchical Likelihood Ratio Tests(hLRT)的GTR作為ML/BI法最佳進化模型。得出以下研究結果和結論:
   (1)建立在系統(tǒng)發(fā)育基礎上,建議將黑龍江林蛙種組(費梁等,2005)的桓仁林蛙劃歸中國林蛙種組。

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