豬NCOA1基因和ADAMTS1基因多態(tài)性及其與繁殖性狀相關(guān)性分析.pdf

1、核受體輔激活蛋白1(NCOA1)基因通過(guò)與結(jié)合到DNA上的核受體相互作用并增強(qiáng)轉(zhuǎn)錄活性，受到影響的雄激素受體、雌激素受體等受體在動(dòng)物的生長(zhǎng)發(fā)育和繁殖等生理過(guò)呈起到重要作用。含凝血酶敏感蛋白模體的去解聯(lián)金屬蛋白酶(ADAMTS1)是新發(fā)現(xiàn)的影響排卵數(shù)的基因。本試驗(yàn)主要以豫南黑豬、杜洛克豬和大約克豬為試驗(yàn)材料，對(duì)這兩種基因的多態(tài)性及其與繁殖性能的關(guān)系進(jìn)行研究，以探討這兩種基因作為分子標(biāo)記在豬育種工作中的應(yīng)用。本實(shí)驗(yàn)采用酚氯仿抽提法提取豬血和

2、豬毛囊基因組DNA。構(gòu)建DNA池，進(jìn)行NCOA1全基因測(cè)序，對(duì)豬NCOA1基因的遺傳變異位點(diǎn)進(jìn)行篩選。應(yīng)用PCR-RFLP技術(shù)，對(duì)3個(gè)品種346頭豬NCOA1外顯子和ADAMTS1基因的SNP位點(diǎn)G223A、T196C、T427C和ADAMTS1基因的SNP位點(diǎn)G72A進(jìn)行群體遺傳學(xué)分析；并用SPSS17.0分析這4個(gè)多態(tài)位點(diǎn)對(duì)豬繁殖性狀的影響。主要研究結(jié)果如下：
　　 1.NCOA1基因遺傳變異分析根據(jù)提取的豬基因組DNA構(gòu)建

3、DNA池，進(jìn)行混合DNA池測(cè)序，發(fā)現(xiàn)住外顯子3、8和12中存在可能的多態(tài)位點(diǎn)，分別設(shè)計(jì)引物，應(yīng)用PCR-RFLP技術(shù)檢測(cè)外顯子3、8和12中的3個(gè)SNP何點(diǎn)分別為G223A、T196C和T427C。測(cè)序結(jié)果表明，這3個(gè)SNP位點(diǎn)分別為G/A、T/C和T/C突變，3個(gè)位點(diǎn)都有2個(gè)等位基和3種基因型。遺傳變異分析發(fā)現(xiàn)，G223A位點(diǎn)A是優(yōu)勢(shì)等位基因(0.509)，優(yōu)勢(shì)基因型為AB型(0.624)，該位點(diǎn)處于Hardy-Weinberg非平衡

4、狀態(tài)，多態(tài)信息含量(PIC)、雜合度(He)、有效等何基因數(shù)(Ne)分別為0.375、0.500、2.000，屬于中度多態(tài)。T196C位點(diǎn)C是優(yōu)勢(shì)等(0.626)，優(yōu)勢(shì)基位基因型為CD型(0.460)，該位點(diǎn)處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)，PIC、He、Ne分別為0.359、0.468、1.881，屬于中度多態(tài)。T427C位點(diǎn)E是優(yōu)勢(shì)等位基因(0.652)，優(yōu)勢(shì)基因型為EF型(0.517)，該位點(diǎn)處于Hardy-Weinber

5、g非平衡狀態(tài)，PIC、He、Ne分別為0.351、0.454、1.831，屬于中度多態(tài)。將檢測(cè)到3個(gè)SNP位點(diǎn)與繁殖性能進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析。結(jié)果顯示：G223A位點(diǎn)各基因型間在總產(chǎn)仔數(shù)、產(chǎn)活仔數(shù)、出生窩重都表現(xiàn)差異極顯著(p<0.01)。T196C位點(diǎn)CC型與CD型基因型間在總產(chǎn)仔數(shù)、產(chǎn)活仔數(shù)差異不顯著(p>0.05)，CC型和CD型與DD型差異極顯著(p<0.01)，出生窩重CC型與CD型差異顯著(p<0.05)，CC型和CD型與DD型差異

6、極顯著(p<0.01)，21日齡窩重都表現(xiàn)差異極顯著(p<0.01)；T427C位點(diǎn)各基因型間在總產(chǎn)仔數(shù)、產(chǎn)活仔數(shù)差異極顯著(p<0.01)，出生窩重和21日齡窩重方面表現(xiàn)相同，均呈現(xiàn)EE型與EF型差異顯著(p<0.05)，與FF型差異極顯著(p<0.01)，EF型與FF型差異極顯著(p<0.01)。
　　 2.ADAMTS1基因遺傳變異分析在ADAMTS1基因的第7外顯子多態(tài)位點(diǎn)的區(qū)域內(nèi)設(shè)計(jì)引物用來(lái)擴(kuò)增含有插入片度的一段序列，

7、應(yīng)用PCR-RFLP技術(shù)檢測(cè)多態(tài)性位點(diǎn)G72A。測(cè)序結(jié)果表明該SNP位點(diǎn)是G/A突變，存在2個(gè)等位基因，3種基因型。遺傳變異分析發(fā)現(xiàn)，G72A位點(diǎn)A是優(yōu)勢(shì)等位基因(0.633)，優(yōu)勢(shì)基因型為AB型(0.457)，該位點(diǎn)處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)，多態(tài)信息含量(PIC)、雜合度(He)、有效等位基因數(shù)(Ne)分別為0.357、0.465、1.868，屬于中度多態(tài)。將該多態(tài)性位點(diǎn)與繁殖性狀相關(guān)的生產(chǎn)數(shù)據(jù)進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析。結(jié)果顯示：

8、G72A位點(diǎn)各基因型間在總產(chǎn)仔數(shù)和產(chǎn)活仔數(shù)均表現(xiàn)為AA型與AB型和BB型差異極顯著(p<0.01)，AB型和BB型差異不顯著(p>0.05)，出生窩重和21日齡窩重都表現(xiàn)為差異極顯著(p<0.01)。
　　 3.根據(jù)單因素LSD法分析不同位點(diǎn)相同基因型以及對(duì)豫南黑豬、杜洛克豬和大約克夏豬繁殖相關(guān)性狀分析得到：大約克夏豬在總產(chǎn)仔數(shù)、產(chǎn)活仔數(shù)、出生窩重和21日齡窩重與豫南黑豬和杜洛克豬兩品種間整體呈現(xiàn)極顯著(p<0.01)，豫南黑豬