高通量測(cè)序和降解組分析白花泡桐鹽脅迫相關(guān)microRNAs.pdf

1、鹽脅迫是影響樹(shù)木生長(zhǎng)和木材產(chǎn)量的主要非生物脅迫之一。越來(lái)越多的研究表明MicroRNAs(miRNAs)在木本植物的生長(zhǎng)發(fā)育、新陳代謝和脅迫響應(yīng)中發(fā)揮重要的作用。為了鑒定分析白花泡桐中與鹽脅迫相關(guān)的miRNAs，本研究構(gòu)建了二倍體白花泡桐對(duì)照組(PF2)和鹽處理組(PF2-S4)兩個(gè)小RNAs文庫(kù)。采用高通量測(cè)序技術(shù)總共鑒定出來(lái)了33個(gè)已知miRNA和80個(gè)新miRNA，在這些miRNAs中分別有27個(gè)（3個(gè)已知miRNA和24個(gè)新mi

2、RNA）差異顯著表達(dá)和有45個(gè)（13個(gè)已知miRNA和32個(gè)新miRNA）差異極顯著表達(dá)。降解組測(cè)序在PF2降解組文庫(kù)中鑒定出來(lái)了34個(gè)miRNA調(diào)控的61個(gè)靶基因;在PF2-S4降解組文庫(kù)中鑒定出來(lái)了35個(gè)miRNA調(diào)控的64個(gè)靶基因。隨后用GO功能注釋對(duì)靶基因進(jìn)行功能分類(lèi)，其中56個(gè)靶基因與分子功能有關(guān)，52個(gè)靶基因與細(xì)胞組成有關(guān)，52個(gè)靶基因與生物學(xué)過(guò)程有關(guān)。最后采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR驗(yàn)證了6個(gè)差異表達(dá)的miRNAs和8個(gè)靶基因，

3、進(jìn)一步驗(yàn)證測(cè)序的準(zhǔn)確性。
　　在本研究中，我們預(yù)測(cè)到的一些白花泡桐miRNA的靶基因。如pfo-miR5021 a/5021b調(diào)控的靶基因與Dof鋅指蛋白和F-box蛋白相關(guān);pfo-miR157a/157b調(diào)控的靶基因與E3泛素蛋白連接酶RGLG2相關(guān);pfo-mir843調(diào)控的靶基因與THO亞族復(fù)合體相關(guān);pfo-mir580調(diào)控的靶基因與組蛋白H2/H2A相關(guān)。這些miRNAs及其靶基因很可能與白花泡桐的抗鹽脅迫相關(guān)。