18678.從頭算方法和abeemσπ模型應(yīng)用于linakbe2mg2ca2與甲基取代的堿基及水相互作用的研究

1、分類號：密級：學(xué)校代碼：10165學(xué)號：201211000961遣掌師籠火擎碩士學(xué)位論文從頭算方法和ABEEM(鄧：模型應(yīng)用于Li／Na／K／Be2／M92／Ca2與甲基取代的堿基及水相互作用的研究作者姓名：學(xué)科、專業(yè)：研究方向：導(dǎo)師姓名：20t5年4月遼寧師范大學(xué)碩士學(xué)位論文摘要采用高水平量子化學(xué)方法MP2／6311州d，p)，研究了Li／Na／K／Be甜瓜蟹／Ca2與甲基化的核酸堿基(A、G、C、T、切及水相互作用的體系baseM(

2、H20)刪=Li／Na／K／BeWM92／Ca2，n=o2)，優(yōu)化了體系的結(jié)構(gòu)，對穩(wěn)定結(jié)構(gòu)進(jìn)行虛頻計(jì)算，并采用BSSE校正結(jié)合能，使用HF／STO3G進(jìn)行了電荷布局分析。結(jié)果表明，二價(jià)金屬離子與配體堿基及水的結(jié)合能要遠(yuǎn)比一價(jià)的大，距離比一價(jià)的小03A左右；隨著水?dāng)?shù)目由0增加到2，金屬離子到配位原子(N／o)的平均距離越來越大，但整體變化幅度都是較小的；電荷分析表明，金屬離子的電荷主要轉(zhuǎn)移到水中。此外，采用相同基組6311qd，p)，不同

3、方法(B3LYP、B3PW91、M062X、MP2、∞B97XD)對金屬離子一堿基體系進(jìn)行結(jié)構(gòu)優(yōu)化和能量計(jì)算，發(fā)現(xiàn)復(fù)合物的穩(wěn)定性順序都相近，不同方法下的相同體系，其結(jié)構(gòu)和能量大致相同。而對于一價(jià)金屬離子，∞B97XD給出了較大的結(jié)合能?？偟膩碚f，B3PW91可給出與MP2方法下最相近的復(fù)合物結(jié)構(gòu)、結(jié)合能。應(yīng)用原子鍵電負(fù)性均衡浮動電荷可極化分子力場(ABEEMox／MM)模型，以從頭算方法所得量子化學(xué)結(jié)果為標(biāo)準(zhǔn)，構(gòu)建fNa／K(H20)4

4、體系的作用勢，并確定了Na和K相關(guān)參數(shù)。將該參數(shù)轉(zhuǎn)移到計(jì)算Na／K的與堿基體系的勢能函數(shù)中，計(jì)算了Na根與堿基的電荷分布、結(jié)構(gòu)和結(jié)合能，得到了與量子化學(xué)計(jì)算相一致的結(jié)果。對于所有的化合物，ABEEMo囂模型所得的電荷分布，與HF／STO3G方法所計(jì)算的電荷分布的線性相關(guān)系數(shù)均在096以上，說明ABEEMo兀模型所計(jì)算的分子的電荷分布可與從頭算的結(jié)果相比擬。同時(shí)，QM與ABEEMordMM優(yōu)化的結(jié)構(gòu)也趨近一致。將Na和K的ABEEMox參