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1、河北師范大學(xué)碩士學(xué)位論文小麥耐鹽相關(guān)基因的克隆與分析姓名:黃勝和申請學(xué)位級別:碩士專業(yè):遺傳學(xué)指導(dǎo)教師:黃占景沈銀柱20050501河北帥范大學(xué)碩十研究生學(xué)位論文摘要植物耐鹽性研究不僅對作物遺傳改良有重要意義,而且還是植物基礎(chǔ)生物學(xué)研究的一個重要組成部分。因此,植物耐鹽相關(guān)基岡的克隆受到人們廣泛的關(guān)注。近年來,隨著分子生物學(xué)的迅速發(fā)展,科學(xué)家們發(fā)現(xiàn)并克隆了一些植物耐鹽相關(guān)基因,但離人們的期望值還相籌很遠(yuǎn)。本研究在本室用cDNA—AFLP
2、得到G09~94號差異eDNA序列的基礎(chǔ)上,通過EST比對進(jìn)行電子克隆,得到一含完整ORF區(qū)的eDNA序列,再以此cDNA序列進(jìn)行Blastn,發(fā)現(xiàn)與水稻一未知功能的基因同源性達(dá)90%。設(shè)計引物,進(jìn)行PCR,測序結(jié)果與電子克隆結(jié)果完全一致,證明克隆成功。Northern雜交顯示,0%Natl處理的H8706—34和RH8706—49幼苗、l%Nacl處理的H8706—34和RH8706—49幼曲都表達(dá)此基因,但1%NaCl處理的RH87
3、06—49表達(dá)量明顯增高因此,將此基岡命名為7aSC(Triticumasetivu$LSa]ttolerantCorrelative),井作為一新基因被GemBank接受(AY956330)。表達(dá)譜基因芯片數(shù)據(jù)庫顯示,用l%NaCl處理RH8706—49小麥幼苗,此基因在葉片中為短時間表達(dá)F調(diào),比時間表達(dá)上調(diào)。半定最RT—PCR結(jié)果證實,用1%NaC]處理,H870634根部TaSC基因表達(dá)量先F降,然后緩慢上升到正常量,而RH870
4、6—49中短時間表達(dá)下調(diào),長時間表達(dá)上凋。比對EST庫結(jié)果表明,7aSC基因在根、N卜種_F、幼穗、子房等組織器官中都有表達(dá),而比對MappedwheatESTs庫結(jié)果可以將TaSC基因定位于染色體5BL、5DL、7DS上。將DNA序列翻譯成蛋白,用多個生物軟件或?qū)I(yè)網(wǎng)站預(yù)測其性質(zhì)、結(jié)構(gòu)、定位和功能,結(jié)果顯示,此蛋白pI值為396,分子量為1531576Da,有4個跨膜區(qū)和1個信號肽區(qū),定位在質(zhì)膜上,與一未知功能的假定膜蛋白同源性為82
5、2%,與另一未知功能的蛋自家族(UFP220)同源性達(dá)798%,并且具有豆蔻?;?、酪氨酸硫酸化、酪蛋白激酶II磷酸化和蛋白激酶C磷酸化等功能位點。因此推測玩孵基因是組成型表達(dá),而且沒有組織器官特異性,同時,可能是植物逆境脅迫反應(yīng)網(wǎng)絡(luò)中的一個中下游基因,其表達(dá)產(chǎn)物參與了多條信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑,將上游反應(yīng)信號轉(zhuǎn)導(dǎo)到下游反應(yīng)元件。以克隆載體為基礎(chǔ),構(gòu)建了雙元表達(dá)載體p1300一TS和p1300一TS—GP,并與對照質(zhì)粒p1300、p1300一GP一
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