用ISSR標(biāo)記分析西雙版納農(nóng)戶旱稻品種的遺傳多樣性.pdf

1、旱稻是栽培稻(OryzasativaL.)適應(yīng)干旱環(huán)境的變種，對(duì)栽培稻的種質(zhì)改良有重要的意義。云南省有豐富的旱稻的種質(zhì)資源，且集中分布在亞熱帶、熱帶的山區(qū)。本研究采用微衛(wèi)星間隔(inter-simplesequencerepeats，ISSR)分子標(biāo)記，對(duì)采集自云南西雙版納州的三個(gè)少數(shù)民族村寨的31個(gè)旱稻品種進(jìn)行了遺傳多樣性分析。本實(shí)驗(yàn)對(duì)旱稻ISSR反應(yīng)條件進(jìn)行了優(yōu)化。從自己設(shè)計(jì)的22個(gè)引物中甄選出適于旱稻的8個(gè)ISSR引物。結(jié)果表明，

2、二核苷酸重復(fù)的微衛(wèi)星要比其他較大重復(fù)的微衛(wèi)星(三核苷酸重復(fù)及四核苷酸重復(fù))更適于進(jìn)行旱稻微衛(wèi)星標(biāo)記分析。其中，GA/CT重復(fù)又比GT/CA重復(fù)能獲得更好的結(jié)果。利用所篩選的8個(gè)引物對(duì)31個(gè)樣品進(jìn)行的ISSRPCR共擴(kuò)增出60條DNA片段，其中多態(tài)性條帶46條，多態(tài)性帶百分率為76.7％，計(jì)算得到的Jaccard相似性系數(shù)在0.415～0.937之間和Nei-Li遺傳距離在0.032～0.413之間，結(jié)果表明取自西雙版納地區(qū)三個(gè)村寨的這3

3、1個(gè)旱稻品種可以檢測(cè)到較高的遺傳多樣性。對(duì)遺傳距離進(jìn)行聚類分析，得到的四個(gè)類群和這些品種所記錄的最初來(lái)源相關(guān)，而與采集的村寨并不相關(guān)。　　比較分析三個(gè)采集村寨之間的遺傳多樣性發(fā)現(xiàn)，不同村寨中旱稻品種的遺傳多樣性不同。巴卡小寨的有效等位基因數(shù)(1.501)、香農(nóng)多樣性指數(shù)(0.4208)、多態(tài)位點(diǎn)百分率(73.33％)最高，巴卡小寨的11個(gè)旱稻品種有較高的遺傳多樣性，接近全部31個(gè)品種的多樣性(1.510，0.4275，76.67％)；