口蹄疫病毒VP1基因的序列分析及巢式PCR檢測研究.pdf

1、本文根據(jù)Genbank中注冊的O型口蹄疫病毒株VP1基因序列，設計出了一對引物，應用RT-PCR方法對疑似口蹄疫病料進行VP1基因的檢測，并對VP1基因進行測序。結果表明，此口蹄疫病毒株的VP1基因的全長639bp，編碼213個氨基酸，國內外發(fā)表的O型毒株VP1基因核苷酸序列相比較的同源性在75.7-93.3％之間。VP1基因所推導氨基酸序列(1D蛋白)同源率在 5.0～92.5％之間。該病料株與臺灣和南通流行的O型口蹄疫病毒株親緣性最

2、近。對VP1基因的序列測定和分析，豐富了我國FMDV毒株VP1基因資料庫。 本研究在應用RT-PCR對VP1基因的擴增和測序的基礎上。選擇VP1基因內相對保守的區(qū)域設計一對引物，建立檢測FMDV VP1基因的巢式PCR方法。通過對RT-PCR產(chǎn)物的二次擴增，能特異性的檢測出500bp左右的目的片段。本試驗所建立的巢式PCR方法特異性好，不與豬水泡病病毒、豬瘟病毒、豬圓環(huán)病毒、豬細小病毒出現(xiàn)交叉反應。通過部標RT-PCR方法和n