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文檔簡介
1、目的:探討PINK1基因rs45530340位點及LRRK2基因rs1491942位點單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism,SNP)與徐州地區(qū)漢族人群晚發(fā)散發(fā)性帕金森病(Parkinson's disease,PD)的相關(guān)性。
方法:收集152例晚發(fā)散發(fā)性PD患者和160名年齡和性別相匹配的健康對照者,入組者均來自中國漢族人群。抽取其外周血并提取全基因組DNA,應(yīng)用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(pol
2、ymerase chain reaction,PCR)擴增包含多態(tài)位點的目的基因片段,通過瓊脂糖凝膠電泳(AGE)檢測PCR產(chǎn)物。對PCR產(chǎn)物分別用DNA限制性內(nèi)切酶N1alV和SmlI進行酶切,用聚丙烯酰胺凝膠電泳(PAGE)、硝酸銀染色檢測酶切產(chǎn)物,采用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)-限制性片段長度多態(tài)性(restriction fragmentlength polymorphism,RFLP)技術(shù)分析基因型。計算所有研究對象兩個SNP位點的基因型
3、頻率和等位基因頻率。定量資料以((x)±s)表示,兩組間定量資料的比較采用t檢驗,計數(shù)資料采用x2檢驗進行統(tǒng)計分析。P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。
結(jié)果:(1) PINK1基因rs45530340位點的基因型以CC為主,PD組為70.4%,對照組為63.8%;等位基因以C為主,PD組(83.6%)高于對照組(80.0%)?;蛐秃偷任换蛟谕戆l(fā)散發(fā)性PD組和正常對照組中的分布差異無統(tǒng)計學(xué)意義(基因型:x2=1.572,P=0
4、.456;等位基因:x2=1.318,P=0.251)。
(2) LRRK2基因rs1491942位點的基因型在PD組以CG為主(44.7%),對照組以GG為主(46.9%);PD組C等位基因頻率高于對照組,分別為43.4%、32.8%?;蛐秃偷任换蛟谕戆l(fā)散發(fā)性PD組與正常對照組中分布差異均有統(tǒng)計學(xué)意義(基因型:x2=6.802,P=0.033;等位基因C:x2=7.448,P=0.006,OR=1.571,95%CI=1
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