青海地方核桃種質(zhì)資源遺傳多樣性研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、本研究通過對青海省核桃主要六大產(chǎn)區(qū)(民和縣,循化縣,尖扎縣,化隆縣,樂都區(qū),貴德縣)的核桃種質(zhì)資源進(jìn)行調(diào)查,共選擇了211份核桃單株作為研究對象,測定了核桃主要經(jīng)濟(jì)性狀指標(biāo),包括:脂肪含量、蛋白質(zhì)含量、主要脂肪酸含量和氨基酸含量,以及DNA遺傳標(biāo)記,分析了不同產(chǎn)區(qū)核桃間的差異性。本研究主要內(nèi)容包括:
 ?、艑α鶄€產(chǎn)區(qū)核桃的主要經(jīng)濟(jì)性狀指標(biāo)的分析表明,不同產(chǎn)區(qū)核桃的內(nèi)含物含量差異較大,多樣性豐富。核桃仁中脂肪含量的變化范圍介于31.

2、21%~70.80%之間,平均為61.92%,脂肪含量的變異系數(shù)為9.69%,單不飽和脂肪酸(油酸)含量變化范圍為7.14%~51.91%,多不飽和脂肪酸(亞油酸,亞麻酸)含量變化范圍為41.93%~84.24%之間,不飽和脂肪酸含量變化范圍為88.22%~95.56%。蛋白質(zhì)含量的變化范圍介于10.02%~25.23%之間,平均為16.94%,蛋白質(zhì)含量的變異系數(shù)為14.76%;氨基酸總含量的變化范圍介于11.1453%~28.542

3、3%之間,平均含量17.4518%,變異系數(shù)較小,變異范圍在4.8296~6.3852%之間,平均變異系數(shù)為5.6582%。不同種類氨基酸的含量差異明顯,在0.4802%~3.7614%之間,平均含量1.1635%,變異系數(shù)較大,變異范圍在14.5814%~26.3897%之間,平均變異系數(shù)為18.0956%。
 ?、扑崛』蚪MDNA的OD260/OD280值在1.72~1.97之間,濃度在120ng/μL~580ng/μL之間

4、,質(zhì)量良好。通過正交試驗(yàn)設(shè)計,分散體系中,影響PCR反應(yīng)的5個因素最佳水平為:0.35mmol·L-1dNTP、0.5umol·L-1Primer、1.75mmol·L-1Mg2+、0.75UTaq Polymerase和80ngDNA。預(yù)混體系中,10μLISSR-PCR最佳反應(yīng)體系為:5μL2×Taq PCRMasterMix、1.5umol·L-1Primer、100 ng DNA和1.5μLH2O。篩選出的12條ISSR引物擴(kuò)增

5、條帶主要集中在100~2000bp之間,條帶數(shù)量從11~19條不等,共產(chǎn)生167條譜帶,平均為13.92條。其中多態(tài)性譜帶127條,平均多態(tài)性比率76.05%。ISSR-PCR檢測結(jié)果顯示:供試材料居群平均水平上的多樣性指數(shù)為:多態(tài)性位點(diǎn)(NP)為100.67個、多態(tài)性位點(diǎn)百分率(PPL)達(dá)60.28%、等位基因數(shù)(A)為1.6028、有效等位基因數(shù)(Ae)為1.3665、遺傳多樣度指數(shù)(H)為0.2156、香農(nóng)指數(shù)(I)為0.3223

6、。有效等位基因數(shù)(Ae)介于1.3456~1.4028;遺傳多樣度指數(shù)(H)變動范圍為0.2071~0.2377。物種水平上的多樣性指數(shù)為:多態(tài)性位點(diǎn)(NP)為127個、多態(tài)性位點(diǎn)百分率(PPL)達(dá)76.05%、等位基因數(shù)(A)為1.7605、有效等位基因數(shù)(Ae)為1.3866、遺傳多樣度指數(shù)(H)為0.2339、香農(nóng)指數(shù)(I)為0.3585。采用POPGENE32軟件計算得出居群總遺傳變異(Ht)為0.2350,居群內(nèi)遺傳變異(Hs

7、)為0.2156,遺傳分化系數(shù)(Gst)為0.0826,表明有8.26%的遺傳分化存在于居群之間,有91.74%的遺傳分化存在于居群之內(nèi),說明了核桃居群之內(nèi)的遺傳分化高于居群之間。供試核桃的基因流(Nm)為5.5527,表明供試核桃居群間存在較大的基因交流。居群間和居群內(nèi)的差異均極顯著(P<0.001)。根據(jù) Nei(1978)的方法計算居群的遺傳距離在0.0154(XH和 MH)~0.0414(MH和JZ)之間,平均值為0.0257。

8、利用核桃的遺傳一致度進(jìn)行UPGMA聚類分析,當(dāng)遺傳一致度在0.98時6個居群可分為3大類,第一類為循化和民和;第二類包括尖扎和化??;貴德和樂都聚為第三類,其中循化和民和遺傳距離較近。12條引物將211份核桃單株完全分開,相似系數(shù)在0.6048~0.9521之間,平均為0.8023。利用UPGMA聚類法對青海地方核桃六個居群的211株樣品進(jìn)行聚類分析,當(dāng)閾值為0.76時可將211個品種單株分成3個大類。通過Cophenetic Corre

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