基因組選擇中一步法的應(yīng)用評(píng)價(jià).pdf

1、基因組選擇能夠通過覆蓋全基因組的高密度SNP標(biāo)記追溯到所有影響目標(biāo)性狀的基因或QTL，從而實(shí)現(xiàn)對(duì)畜禽個(gè)體育種值的準(zhǔn)確預(yù)測。因此，基因組選擇方法具有估計(jì)育種值的準(zhǔn)確性高等優(yōu)勢，同時(shí)可通過早期基因型測定實(shí)現(xiàn)早期評(píng)估和早期選種，進(jìn)而縮短世代間隔。實(shí)施基因組選擇技術(shù)需要對(duì)個(gè)體進(jìn)行基因型分型，然而對(duì)一些經(jīng)濟(jì)價(jià)值較小的物種（豬或家禽）而言，在實(shí)際育種中進(jìn)行全部個(gè)體基因分型是不現(xiàn)實(shí)的，而一步法允許部分個(gè)體進(jìn)行基因分型即可實(shí)施基因組選擇，有效的克服這些

2、物種施基因組選擇的一些問題。
　　本研究通一步法在黃羽肉雞群體中的驗(yàn)證，以及基于豬實(shí)際性狀遺傳結(jié)構(gòu)全基因組數(shù)據(jù)表型缺失時(shí)和表型已知時(shí)模擬驗(yàn)證，并且探討一步法在豬實(shí)際育種過程中候選群個(gè)體測定基因型比例大小、測定基因型個(gè)體的選擇。通過對(duì)育種值估計(jì)的準(zhǔn)確性、無偏性及選擇反應(yīng)等結(jié)果分析，主要得出以下結(jié)論：
　　1.本研究中基于R語言開發(fā)基因組選擇一步法計(jì)算評(píng)估軟件。經(jīng)過測試，程序穩(wěn)定可靠，親緣關(guān)系矩陣構(gòu)建靈活可變，可用于畜禽基因組選

3、擇遺傳評(píng)定計(jì)算軟件的選擇；
　　2.一步法在真實(shí)數(shù)據(jù)驗(yàn)證表明:在采食類、生長類和胴體類三類性狀中一步法準(zhǔn)確性與無偏性優(yōu)于傳統(tǒng)BLUP、GBLUP方法。三大類性狀提高幅度依次為：生長類性狀5.4％~13.9%、胴體類性狀3%~10.1%、采食類性狀0.2%~10.7%；
　　3.一步法在模擬數(shù)據(jù)驗(yàn)證表明:無論是驗(yàn)證群在表型缺失時(shí)或表型已知時(shí)，一步法的準(zhǔn)確性優(yōu)于傳統(tǒng)BLUP和GBLUP方法（分別提高~25%、~4%）。一步法在低