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文檔簡(jiǎn)介
1、中國(guó)醫(yī)科大學(xué)博士學(xué)位論文胃癌相關(guān)基因的克隆與鑒定姓名:任群申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別:博士專(zhuān)業(yè):細(xì)胞生物學(xué)指導(dǎo)教師:張學(xué)2003.4.1性、化學(xué)物理性,以及病毒性致癌因素只是誘因,而基因改變才是導(dǎo)致細(xì)胞生長(zhǎng)發(fā)育的正負(fù)調(diào)控和功能紊亂的分子基礎(chǔ)。因此,開(kāi)展胃癌相關(guān)基因的克隆和鑒定工作,是我國(guó)圍繞基因組計(jì)劃開(kāi)展的一項(xiàng)重要具體工作,具有重要的意義。本文采用染色體雜合性丟失研究(10ssofheterozygosity,LOH)、篩查胃癌相關(guān)單個(gè)基因的突變以及
2、抑制性消減雜交(suppressedsubtraetivehybrizadtion,SSH)的方法發(fā)現(xiàn)并鑒定胃癌的相關(guān)基因,將為胃癌的深入研究打下基礎(chǔ)。材料和方法胃癌標(biāo)本來(lái)源于中國(guó)醫(yī)科大學(xué)附屬第一臨床學(xué)院腫瘤科患者,手術(shù)切取胃癌組織及距癌組織1厘米以上的癌旁正常組織。手術(shù)切取胃癌組織及癌旁正常組織均經(jīng)病理證實(shí)。118號(hào)染色體的雜合性丟失分析選擇18號(hào)染色體的9對(duì)短插入/缺失多態(tài)(ShortInsertionDeletionP01ymor
3、phism,SIDP)標(biāo)記,以激光捕獲顯微切割(LaserCaptureMeerodissection,LCM)一高可信度全基因組擴(kuò)增(highfidelity—wholegenomeamplification,HF—wGA)一變性高效液相色譜(DenaturingHighPerformanceLiquidChromatography,DHPLC)聯(lián)合技術(shù)進(jìn)行LOH的分析,與癌旁正常組織相比,癌組織DNA的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的DHPLC色譜
4、蜂數(shù)目減少或色譜峰相對(duì)高度減少50%以上判定為L(zhǎng)OH,所有陽(yáng)性病例應(yīng)用變性聚丙烯酰胺凝膠電泳加硝酸銀染色證實(shí)。2KLF6基因的突變分析聯(lián)合應(yīng)用PCR和DHPLC技術(shù)對(duì)35例胃癌患者組織進(jìn)行ⅪJ唔基因編碼區(qū)全部外顯子序列突變篩查。與正常組織的色譜峰型進(jìn)行比較,在部分變性溫度條件下,相應(yīng)腫瘤組織色譜蜂的個(gè)數(shù)和蜂的對(duì)稱(chēng)性改變,如出現(xiàn)肩峰及不對(duì)稱(chēng)峰,說(shuō)明有變異發(fā)生。將此PCR產(chǎn)物純化后測(cè)序,然后與基因庫(kù)序列比較確定變異性質(zhì)。3BRAF基因v59
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