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1、目的:應(yīng)用基因芯片技術(shù)分析硼替佐米敏感多發(fā)性骨髓瘤細(xì)胞株KM3與耐藥多發(fā)性骨髓瘤細(xì)胞株KM3/BTZ基因表達(dá)的差異性,探討硼替佐米耐藥相關(guān)基因及耐藥發(fā)生機(jī)制。
方法:1.采用Affymetrix U133 plus2.0全基因組表達(dá)譜芯片,分析KM3與KM3/BTZ之間的基因表達(dá)。
2.采用RT-PCR法進(jìn)一步檢測(cè)基因表達(dá)的差異性。
3.采用Western Blot法進(jìn)一步檢測(cè)差異基因蛋白表達(dá)水平的差異性。
2、
4.采用RT-PCR法檢測(cè)初診多發(fā)性骨髓瘤患者與難治復(fù)發(fā)多發(fā)性骨髓瘤患者差異基因的表達(dá)。
5.運(yùn)用分子注釋系統(tǒng)MAS3.0軟件和已知耐藥相關(guān)基因進(jìn)行數(shù)據(jù)分析。
結(jié)果:1.KM3/BTZ與KM3相比,670個(gè)基因的表達(dá)具有差異性,差異表達(dá)10倍以上基因32個(gè),主要涉及轉(zhuǎn)錄調(diào)控、信號(hào)傳導(dǎo)通路等生物效應(yīng)過(guò)程分子;HSPB2、ZNF及MS4A家族部分基因在KM3中低表達(dá),然而在KM3/BTZ中明顯上調(diào);
3、 2.RT-PCR法檢測(cè)顯示,在KM3和KM3/BTZ細(xì)胞中,除JUN基因,其他7個(gè)基因(CA12、CYP1B1、EPB41 L3、HSPB2、MS4A4A、SDPR、PAWR)與芯片檢測(cè)表達(dá)差異結(jié)果相符。
3.Western Blot法檢測(cè)顯示,Par4蛋白表達(dá)與芯片檢測(cè)表達(dá)差異結(jié)果相符。
4.復(fù)發(fā)進(jìn)展MM患者PAWR基因表達(dá)水平(0.034±0.013),明顯低于初診MM患者PAWR基因表達(dá)水平(0.11±0.0
4、53),P<0.05。
5.采用分子注釋系統(tǒng)(MAS)3.0中的GO生物學(xué)過(guò)程對(duì)基因表達(dá)差異富集分析顯示,耐藥細(xì)胞株相對(duì)于原代細(xì)胞株上調(diào)基因的表達(dá)差異主要參與免疫反應(yīng)、依賴DNA的轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)、轉(zhuǎn)錄、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、絲裂原活化蛋白激酶(MAPK)、細(xì)胞黏附及神經(jīng)系統(tǒng)發(fā)育等方面。下調(diào)基因主要集中在信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、離子轉(zhuǎn)運(yùn)、依賴DNA的轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)、轉(zhuǎn)導(dǎo)及細(xì)胞黏附。
結(jié)論:1.在KM3與KM3/BTZ篩選中,ZNF、MS4A家族部分成員以及
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