Notch信號通路中的Notch2、Hey2基因在單純房間隔缺損、室間隔缺損中的突變研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、目的：通過篩查Notch信號通路中 Notch2、Hey2在先天性房間隔缺損(Atrial septal defect,ASD)及室間隔缺損(Ventricular septal defect,VSD)突變和單核氨酸多態(tài)性(Single Nucleotide Polymorphisms,SNP),探討基因Notch2、Hey2與先天性心臟病發(fā)病(Congential Heart Disease,CHD)發(fā)病機(jī)制的相關(guān)性,為Notch信號

2、通路在先天性心臟病發(fā)生學(xué)提供理論依據(jù)支持。
　　方法：選擇先天性房間隔缺損、室間隔缺損患者各50例和健康兒童100例,應(yīng)用聚合酶鏈反應(yīng)(Polymerase chain reaction,PCR)方法擴(kuò)增Notch2基因的第7、8、32、33、34外顯子和Hey2基因的所有5個外顯子的序列,PCR產(chǎn)物純化后經(jīng)DNA測序儀直接測序,然后與NCBI數(shù)據(jù)庫中Notch2、Hey2基因的序列進(jìn)行比對,并與健康對照組比較,觀察Notch2、

3、Hey2基因突變情況;利用生物信息學(xué)方法預(yù)測Notch2、Hey2基因點(diǎn)突變對其蛋白結(jié)構(gòu)和功能影響。
　　結(jié)果：⑴在Notch2基因的第7號、8號、33號外顯子沒有找到任何突變位點(diǎn);在32號外顯子發(fā)現(xiàn)4個新的雜合性突變位點(diǎn):2個錯義突變 c.C5903T(p.Ala1968Val)、c.A5972T(p.His1976Leu)分別在1例ASD和1例VSD患者上發(fā)現(xiàn),2個同義突變c.C5842T(p.Leu1948Leu)、c.C5

4、925T(p.Asp1975Asp)分別在2例ASD和1例ASD患者上發(fā)現(xiàn);在34號外顯子中發(fā)現(xiàn)10例雜合性突變位點(diǎn),4個錯義突變:c.C6178T、c.A6343G、c.A7375G、c.C6313T,其中,c.C6178T和c.A6343G分別在3例ASD和1例VSD患者上發(fā)現(xiàn),c.A7375G、c.C6313T則在健康兒童對照組中發(fā)現(xiàn);6個同義突變:c.C6561T、c.A6435G、c.C6184T、c.C6159T、c.C64

5、21T、c.T7341A,其中 c.C6561T在2例 ASD中發(fā)現(xiàn),c.A6435G和c.C6184T各在1例VSD中發(fā)現(xiàn),c.C6159T在1例健康對照組中發(fā)現(xiàn),c.C6421T分布在6例ASD、4例VSD和7例健康對照組中,c.T7341A分布在4例ASD、3例VSD和7例健康對照組中。cDNA6421和 cDNA7341的等位基因頻率和基因型頻率在實(shí)驗(yàn)組和對照組間分布的差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P均>0.05)。⑵采用SIFT和 Pol

6、yPhen兩種生物信息學(xué)方法對Notch2基因的c.C5903T(p.Ala1968Val)、c.A5972T(p.His1976Leu)、c.C6178T(p.Arg2060Cys)、c.A6343G(p.Ser2115Gly)4個突變位點(diǎn)分析結(jié)果提示,c.C5903T與c.C6178T突變位點(diǎn)有可能影響蛋白功能,而c.A5972T與c.A6343G對蛋白質(zhì)功能的影響是良性的。⑶HEY2基因的所有外顯子沒有發(fā)現(xiàn)伴氨基酸改變的錯義突變,

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