基于生物網(wǎng)絡(luò)模塊的蛋白質(zhì)組差異表達(dá)統(tǒng)計模型研究.pdf

1、蛋白質(zhì)差異表達(dá)分析對于我們認(rèn)識生物的分子機理以及復(fù)雜疾病的發(fā)病機制有著重要的作用。隨著基于質(zhì)譜技術(shù)的蛋白質(zhì)組學(xué)的不斷發(fā)展，根據(jù)譜圖數(shù)來分析蛋白質(zhì)組表達(dá)差異的方法在分析復(fù)雜蛋白質(zhì)混合物中的應(yīng)用越來越廣泛。已有的蛋白質(zhì)組差異表達(dá)分析方法主要是通過在單個的蛋白質(zhì)層面上對其進(jìn)行逐個分析。但是，蛋白質(zhì)之間是具有相互作用的，大多數(shù)生物學(xué)功能都不是僅通過單個蛋白質(zhì)來實現(xiàn)的。
　　本課題考慮到了蛋白質(zhì)間的相互作用，為了提高統(tǒng)計效力與數(shù)據(jù)的可解釋性

2、，針對高通量蛋白質(zhì)組差異表達(dá)統(tǒng)計分析構(gòu)建了結(jié)合生物網(wǎng)絡(luò)模塊信息的負(fù)二項分布統(tǒng)計模型，其中生物網(wǎng)絡(luò)包括代謝通路以及蛋白互作網(wǎng)絡(luò)的信息。我們首先對此模型進(jìn)行了計算機模擬，模擬結(jié)果顯示了該模型能有效地鑒定出差異顯著的模塊。然后我們利用此模型對一套真實的頭頸鱗癌蛋白質(zhì)組差異表達(dá)譜進(jìn)行了統(tǒng)計分析，鑒定了在疾病與健康條件下蛋白質(zhì)表達(dá)水平發(fā)生顯著變化的功能模塊，并與基于單個蛋白質(zhì)的統(tǒng)計方法進(jìn)行了比較，證明了結(jié)合生物網(wǎng)絡(luò)模塊信息的統(tǒng)計模型能有效地鑒定出