系統(tǒng)性紅斑狼瘡外周血單個核細胞基因表達模式.pdf

1、本研究分為二部分：
　　 第一部分:系統(tǒng)性紅斑狼瘡外周血單個核細胞基因表達系列分析文庫的生物信息學分析
　　 目的:分析已構建的系統(tǒng)性紅斑狼瘡外周血單個核細胞基因表達系列分析文庫，勾畫系統(tǒng)紅斑狼瘡外周血單個核細胞的基因表達模式。
　　 方法:利用SAGE 2000V 4.5對已建立的SAGE文庫產(chǎn)生的測序文件進行統(tǒng)計分析,上傳SLE 患者20個高表達基因到http://david.niaid.nih.gov/da

2、vid/ease.htm，得到基因的功能注釋，利用卡方檢驗篩選表達差異的基因。
　　 結果:文庫測序共1814個SAGE標簽（tag），由1286 序列不同的tag組成。這些tag中，單拷貝tag 占86.6%，僅0.2%tag 多于20 拷貝。與已知表達序列相配的tag 占68.4%，其中41.1%的tag 能與多個表達序列匹配；31.6%的tag不能和已知表達序列配對，它們可能代表新基因。20個高表達基因與正常人文庫比較發(fā)現(xiàn)

3、3個差異表達的基因。
　　 結論:研究勾畫出系統(tǒng)性紅斑狼瘡外周血單個核細胞基因表達概貌。通過對比分析正常人和SLE 患者的SAGE 文庫的生物學信息，將有助于我們了解系統(tǒng)性紅斑狼瘡的發(fā)病機制。
　　 第二部分：RT-PCR驗證系統(tǒng)性紅斑狼瘡外周血單個核細胞SAGE 文庫中神經(jīng)顆粒素的差異表達
　　 目的:測定神經(jīng)顆粒素在系統(tǒng)性紅斑狼瘡患者和正常人中的表達情況。
　　 方法:SAGE 生物學分析。RT-P

4、CR的方法驗證35例系統(tǒng)性紅斑狼瘡患者和15例正常人神經(jīng)顆粒素mRNA表達水平，分析神經(jīng)顆粒素mRNA表達水平與SLE活動性指數(shù)（SLEDAI）相關性。
　　 結果:比較系統(tǒng)性紅斑狼瘡患者和正常人SAGE 文庫篩選出差異表達基因神經(jīng)顆粒素，活動期SLE 神經(jīng)顆粒素mRNA水平高于緩解期（p<0.05）及正常對照組（p<0.001），緩解期高于正常對照組（p<0.05）。系統(tǒng)性紅斑狼瘡患者Ng mRNA 水平與SLEDAI 正相關