福建地區(qū)維生素D受體基因多態(tài)性與多發(fā)性骨髓瘤的相關性研究.pdf

1、目的：研究福建地區(qū)健康人群和多發(fā)性骨髓瘤(Multiple Myeloma，MM)患者維生素D受體(Vitamin D Receptor，VDR)基因多態(tài)性及其單體型的分布，并探討VDR多態(tài)性與MM的相關性；分析VDR多態(tài)性在福建地區(qū)與世界不同種族人群中的分布；以期發(fā)現(xiàn)MM患者在本次研究位點鄰近新的SNP和突變。
　　方法：采用病例-對照研究方法，收集福建地區(qū)40例MM患者和84例健康體檢者（同期同地區(qū)年齡性別匹配）的外周血，運用

2、聚合酶鏈反應(PCR)和 DNA直接測序法對VDR基因FokI、BsmI、ApaI、TaqI位點進行SNPs檢測，運用SHEsis在線生物信息學軟件對以上位點的基因型、等位基因、連鎖不平衡（LD）、單體型分布特征進行分析。同時收集MM患者起病年齡、性別、吸煙史、分型、ISS分期、起病情況、25-羥總VD、β2微球蛋白、血清白蛋白、乳酸脫氫酶、血鈣、血紅蛋白等臨床資料，運用PASW Statistics18統(tǒng)計學軟件進行基因型與臨床資料相

3、關性分析。
　　結(jié)果：
　　1、病例組和對照組各位點均符合Hardy-Weinberg遺傳平衡，BsmI位點A等位基因分布頻率在實驗組（8.7％）顯著高于對照組（2.4%），差異有統(tǒng)計學意義（P=0.025），為MM高風險性等位基因；TaqI位點C等位基因分布頻率在實驗組（10.5%）高于對照組（3.6%），差異有統(tǒng)計學意義（P=0.030），為MM高風險性等位基因。未發(fā)現(xiàn)4個位點的基因型和FokI、ApaI的等位基因與MM

4、患病風險相關。
　　2、分析病例組4個位點基因型與臨床指標的相關性，發(fā)現(xiàn)FokI與性別(P=0.018)、吸煙史(P=0.008)、血鈣(P=0.016)，ApaI與起病年齡(P=0.019)具有相關性。未發(fā)現(xiàn)這兩個位點與其它臨床指標有相關性。BsmI、TaqI位點與所收集的臨床指標均無相關性。
　　3、福建地區(qū)健康人群FokI位點頻率與所報道的漢族北京人群、日本人群、歐洲人群頻率無統(tǒng)計學差異（P＞0.05）；與非洲人群的頻

5、率有顯著性差異（P＜0.05）。BsmI位點頻率與所報道的漢族北京人群頻率無統(tǒng)計學差異（P＞0.05）；與日本人群、歐洲人群、非洲人群頻率有顯著性差異（P＜0.05）。ApaI位點頻率與所報道的漢族北京人群和日本人群頻率無統(tǒng)計學差異（P＞0.05）；與歐洲人群、非洲人群的頻率有顯著性差異（P＜0.05）。TaqI位點與所報道的漢族北京人群頻率無統(tǒng)計學差異（P＞0.05）；與日本人群、歐洲人群、非洲人群的頻率有顯著性差異（P＜0.05）。

6、
　　4、分析遺傳標記兩兩之間連鎖不平衡，發(fā)現(xiàn)4個位點中BsmI-TaqI之間存在連鎖不平衡（LD），而本次發(fā)現(xiàn)的BsmI、TaqI等位基因與MM易感相關，說明BsmI、TaqI位點之間有很好的相互代表性；未發(fā)現(xiàn)BsmI-TaqI組成的單體型與MM易感性相關。而FokI-Bs mI-Apa I-TaqI可組成9種可能的單體型，CGGT是病例組和對照組中最常見的單體型，病例組的頻率（31.1%）低于對照組（45.9%），組間比較差異

7、有統(tǒng)計學意義（P=0.044），OR為0.544，95%CI為0.310～0.988，可能為MM的保護性單體型；CATC單體型在病例組的頻率（4.6%）明顯高于對照組（0%），組間比較差異有統(tǒng)計學意義（P=0.004），可能為MM的易感單體型。
　　5、1例MM病人同時出現(xiàn)兩種北京漢族人群和日本人群罕見的基因型（BsmI AA基因型和TaqI CC基因型）。
　　6、1例MM病人存在VDR基因cDNA1421位點CA雜合型（

8、ATC→ATA，均編碼異亮氨酸，位于9號外顯子內(nèi)），對照組未發(fā)現(xiàn)，經(jīng)NCBI證實為同義突變。
　　7、MM患者還存在rs11574113G>C、rs2229829C>A.、rs201747972C>T多態(tài)位點，與FokI、BsmI、ApaI、TaqI位點相同，都與無義介導的mRNA降解（NMD）相關。
　　結(jié)論：
　　1、VDR基因多態(tài)性可作為潛在評估MM患病風險的分子標記。
　　2、FokI、Bs mI、Apa