MicroRNA-133b在食管鱗狀細(xì)胞癌中的表達(dá)及調(diào)控.pdf_第1頁
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文檔簡(jiǎn)介

1、研究背景及目的:
  食管癌(esophagealcancer,EC)是最常見消化道惡性腫瘤之一,發(fā)病率及死亡率分別位居所有惡性腫瘤中的第八位和第六位,主要病理類型分有鱗狀細(xì)胞癌(esophagealsquamouscellcarcinomaESCC)和腺癌(esophagealadenocarcinoma,EAC)兩大類,其中絕大部分為ESCC;我國(guó)是EC發(fā)病率和死亡率最高的國(guó)家之一,其發(fā)病率位居惡性腫瘤的第4位。由于EC明確診

2、斷時(shí)很多病例都處于局部晚期或淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移,同時(shí)治療上缺乏靶向性,因此,目前EC預(yù)后效果仍舊不佳,術(shù)后總的5年生存率僅10-20%。更好的闡明EC的生物學(xué)行為,了解其發(fā)病機(jī)制對(duì)發(fā)展高效、特異性強(qiáng)的診斷方法和治療策略及提高EC術(shù)后生存具有重要意義。
  微小RNA(miRNA)是一種長(zhǎng)約21-25核苷酸的非編碼單鏈內(nèi)源性RNA分子,進(jìn)化上高度保守,主要通過轉(zhuǎn)錄后及翻譯水平負(fù)性調(diào)控基因表達(dá),在機(jī)體生長(zhǎng)發(fā)育、細(xì)胞分化增殖、細(xì)胞凋亡、激素分泌

3、和腫瘤形成等多個(gè)環(huán)節(jié)中起著重要的作用。近來,越來越多研究證明,miRNA的生成及功能異常與多種惡性腫瘤的發(fā)生、發(fā)展密切相關(guān),在腫瘤發(fā)生過程中類似癌基因或抑癌基因。
  研究證據(jù)提示miRNA參與了食管癌的發(fā)生、發(fā)展等病理過程,但具體作用機(jī)制仍舊未完全闡述清楚。因此,進(jìn)一步研究食管癌中miRNA表達(dá)譜及對(duì)異常表達(dá)miRNAs進(jìn)行功能分析有助于揭示食管癌發(fā)病新機(jī)制,同時(shí)為食管癌早期診斷、預(yù)后判斷及新的治療策略提供思路。
  本課

4、題從研究食管鱗癌miRNAs表達(dá)譜著手,分析異常表達(dá)的miRNA在食管鱗癌中可能的作用機(jī)制。研究首先擬采用生物基因芯片分析并比較食管鱗狀細(xì)胞癌與正常食管鱗狀上皮粘膜miRNAs表達(dá)譜差異,篩選并驗(yàn)證食管鱗狀細(xì)胞癌中相關(guān)特異的、異常表達(dá)的miRNAs,并確定其靶基因;進(jìn)而,研究食管鱗癌異常表達(dá)的miRNAs及其靶基因在食管鱗癌發(fā)生、發(fā)展中的作用機(jī)制、以及可能的治療潛力。本課題研究提示了異常表達(dá)的miRNAs在食管鱗狀細(xì)胞癌發(fā)生、發(fā)展中扮演

5、了重要角色,也為食管鱗狀細(xì)胞癌早期診斷和預(yù)后判斷及靶向治療提供理論據(jù)。
  第一部分食管鱗狀細(xì)胞癌中特異miRNAs鑒定
  目的:
  分析比較食管鱗狀細(xì)胞癌中miRNAs表達(dá)譜,篩選并驗(yàn)證食管鱗癌相關(guān)、特異性的miRNAs。
  方法:
  利用TaqManMicroRNAArray生物芯片檢測(cè)并比較13對(duì)食管鱗癌及癌旁正常粘膜組織標(biāo)本的miRNAs表達(dá)譜,篩選出ESCC中異常表達(dá)的miRNAs;通過分

6、析比較并結(jié)合文獻(xiàn)報(bào)道,從31個(gè)候選miRNAs中選定了10個(gè)進(jìn)行初步分析,運(yùn)用實(shí)時(shí)定量PCR(Real-timequantitativePCR)方法在20配對(duì)ESCC及癌旁組織標(biāo)本中初步驗(yàn)證了miR-21,miR-135b,miR-133b等3個(gè)表達(dá)異常的miRNAs;在50對(duì)ESCC及癌旁組織標(biāo)本中進(jìn)一步驗(yàn)證上述3個(gè)異常癌表達(dá)miRNAs的表達(dá)水平,確認(rèn)與ESCC組織相關(guān)特異的miRNAs。
  結(jié)果:
  1,通過生物芯

7、片,發(fā)現(xiàn)食管鱗癌組織中31個(gè)miRNAs表達(dá)異常。
  2,利用qRT-PCR技術(shù),在配對(duì)大樣本食管鱗癌和癌旁正常粘膜組織篩選并驗(yàn)證,確定miR-21,miR-135b,miR-133b是ESCC相關(guān)的miRNAs。
  結(jié)論:
  miR-21,miR-135b,miR-133b是ESCC相關(guān)、特異的miRNAs。
  第二部分miRNA-133b靶基因的預(yù)測(cè)及驗(yàn)證
  目的:
  預(yù)測(cè)并確認(rèn)miR

8、-133b下游靶基因。
  方法:
  運(yùn)用生物信息學(xué)方法并結(jié)合文獻(xiàn)分析,從MiRbase、Targetscans及PicTar等靶基因預(yù)測(cè)數(shù)據(jù)信息庫(kù)中預(yù)測(cè),篩選出與腫瘤密切相關(guān)的基因作為miR-133b在ESCC中候選靶基因;然后,在40對(duì)配對(duì)ESCC及癌旁正常粘膜組織中,運(yùn)用qRT-PCR、蛋白印記法(WesternBlot)及免疫組織化學(xué)(Immunohistochemistry,IHC)等方法檢測(cè)候選基因的表達(dá)水平,

9、運(yùn)用qRT-PCR檢測(cè)miR-133b表達(dá)水平,并比較miR-133b與候選基因表達(dá)水平的相關(guān)性,確定miR-133b下游靶基因。
  結(jié)果:
  1,通過miRNAs數(shù)據(jù)庫(kù)預(yù)測(cè)并結(jié)合文獻(xiàn)分析,預(yù)測(cè)LASP1、CDKN2AIP及BCL2L2可能是miR-133b的靶基因;
  2,運(yùn)用qRT-PCR、WestemBlot方法分析3個(gè)候選靶基因與miR-133b的關(guān)系,在ESCC組織中,我們發(fā)現(xiàn)miR-133b表達(dá)水平下

10、調(diào),而LASP1在mRNA及蛋白水平表達(dá)均上調(diào),兩者表達(dá)水平呈明顯的負(fù)相關(guān)(相關(guān)系數(shù)=-0.499,p=0.011);而其他兩個(gè)基因與miR-133b表達(dá)水平無相關(guān)性;免疫組化揭示LASP1在食管鱗癌組織的細(xì)胞質(zhì)及細(xì)胞核中均有表達(dá)。
  結(jié)論:
  LASP1為miR-133b的下游靶基因。
  第三部分miRNA-133b及LASP1在食管鱗狀細(xì)胞癌發(fā)病中作用機(jī)制探討
  目的:
  揭示miR-133b

11、及LASP1在食管鱗狀細(xì)胞癌發(fā)生、發(fā)展中可能作用機(jī)制。
  方法:
  體外培養(yǎng)食管鱗狀細(xì)胞癌細(xì)胞株ECA109、KYSE510,運(yùn)用基因獲得和/或缺失功能研究(gain/loss-of-function)技術(shù),瞬時(shí)傳染miR-133b-mimic及siRNA-LASP1后,運(yùn)用qRT-PCR方法檢測(cè)miR-133b表達(dá)水平變化,運(yùn)用qRT-PCR、WesternBlot等方法LASP1的表達(dá)水平變化;同時(shí)運(yùn)用MTTassa

12、y方法檢測(cè)細(xì)胞增殖;AnnexinV-FITCassay方法檢查對(duì)細(xì)胞凋亡的影響;Millcell實(shí)驗(yàn)檢測(cè)細(xì)胞侵襲能力和遷移能力。
  結(jié)果:
  1,在ECA10、KYSE510細(xì)胞中,miR-133b-mimic轉(zhuǎn)染72小時(shí)后miR-133b表達(dá)水平明顯上調(diào)(p=0.000,p=0.024);而LASP1的mRNA表達(dá)水平明顯下調(diào)(p=0.017,p=0.006)。
  2,在ECA10、KYSE510細(xì)胞中,si

13、R-LASP1轉(zhuǎn)染72小時(shí)后miR-133b表達(dá)水平無明顯變化,而LASP1的mRNA(p=0.006,p=0.039)及蛋白表達(dá)水平均明顯下調(diào)(p=0.003,p=0.001)。
  3,MTTassay方法檢測(cè)細(xì)胞增殖,轉(zhuǎn)染miR-133b-mimic或siR-LASP1后72小時(shí),ECA109、KYSE510細(xì)胞株增殖能力下降最明顯;聯(lián)合miR-133b-mimic和siR-LASP1轉(zhuǎn)染后ECA109、KYSE510細(xì)胞株

14、增殖能力較單一轉(zhuǎn)染miR-133b-mimic或siR-LASP1下降更明顯(p=0.000,p=0.002;p=0.007,p=0.027)。4,Millcell侵襲實(shí)驗(yàn)中,ECA109及KYSE510細(xì)胞株轉(zhuǎn)染miR-133b-mimic或siR-LASP1后18小時(shí),侵襲能力較對(duì)照組明顯下降(p=0.001,p=0.000;p=0.001,p=0.000)。
  5,Millcell遷移實(shí)驗(yàn)中,ECA109及KYSE510細(xì)

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