單核苷酸多態(tài)與胃癌侵襲相關性研究.pdf

1、中國醫(yī)科大學博士學位論文單核苷酸多態(tài)與胃癌侵襲相關性研究姓名：李愛琳申請學位級別：博士專業(yè)：臨床醫(yī)學；腫瘤學指導教師：王振寧201205提取的DNA樣本，并收集匹配的404例健康個體外周血提取的DNA樣本，利用MALDITOFMS進行基因型分析，目的為研究肝素酶基因和NMEl基因單個SNPs位點及其構(gòu)成的單體型與胃癌易感性、臨床病理特征及預后的相關性，以尋找功能性SNPs及單體型作為預測胃癌侵襲能力及預后的分子標記，這對胃癌的防治具有重

2、要的意義。方法1、實驗標本收集病例組標本來源為404例胃癌患者術后石蠟包埋正常胃組織，對照組標本來源為年齡性別與病例組一比一匹配404名健康人外周血。2、基因組DNA提取福爾馬林固定的石蠟包埋組織應用QIAamp@DNAFFPE提取試劑盒(德國)提取DNA，外周血DNA提取應用TaKaRa全基因組DNA提取試劑盒，依說明書描述操作。3、基因分型我們使用MALDITOFMS方法進行基因分型，針對每一個SNP分別設計正向引物、反向引物、延伸

3、探針，按樣品數(shù)的1％加入陰性對照，按樣品數(shù)的1％N入室內(nèi)質(zhì)控標準品對照，按樣品數(shù)的5％隨機選取樣品做為重復實驗復核?；蛐头治龅牟僮魅藛T不知道所檢測標本的病例或?qū)φ諏傩浴?、統(tǒng)計分析統(tǒng)計分析用PASWStatisticslg0(SPSS，Inc，Somers，NY，USA)軟件進行應用了貯檢驗，置換檢驗，非條件性logistic回歸模型，KaplanMeier生存分析，logrank檢驗，單因素和多因素Cox回歸分析。并使用Haplov