十個(gè)綿羊品種mtDNA遺傳多態(tài)性與系統(tǒng)進(jìn)化研究.pdf

1、為了進(jìn)一步明確我國(guó)地方綿羊品種的起源、分類(lèi)及遺傳關(guān)系，本研究從中國(guó)甘肅、寧夏、陜西、山東、河南、新疆、青海等省、市自治區(qū)采集了蘭州大尾羊(Lanzhou largetail sheep，LLT)、灘羊(Tan sheep，TS)、同羊(Tong sheep，TTS)、小尾寒羊(Small-tail han sheep，STH)、大尾寒羊(Large-tail han sheep，LTH)、阿勒泰羊(Aletail sheep，ALT)、

2、西藏羊(Tibetan sheep，TBS)、多浪羊(Duolang sheep，DL)8個(gè)地方品種，并在陜西榆林采集了2個(gè)外來(lái)純種薩?？司d羊(Suffolk sheep，SFK)和道塞特綿羊(Dorset sheep，DST)作為對(duì)照。本試驗(yàn)采用上游引物L(fēng)15387:5'AGCCCCACTATCAACACC3’和下游引物H16149:5'AAATAGTTACCCCCACAGTTAG3’。具體擴(kuò)增序列位置是靠近tRNApro一側(cè)的D-l

3、oop 763 bp，其中包含了D-loop上游50 bp。并通過(guò)測(cè)序分析D-loop高變區(qū)序列對(duì)我國(guó)的綿羊品種進(jìn)行起源進(jìn)化和多態(tài)性研究，結(jié)果如下： 1.本試驗(yàn)所研究序列已提交GenBank，登錄號(hào)：EF494774～EF494792，EF494802～EF494826，EF494875～EF600931，EF494842～EF600924，EF494866～EF600929，EF600912～EF600917。供試綿羊mtDN

4、AD-loop HVI序列A、T含量占優(yōu)勢(shì)，其中國(guó)綿羊品種與外來(lái)品種mtDNAD-loop序列堿基組成沒(méi)有明顯的差異，說(shuō)明了綿羊mtDNAD-loop為A、T富集區(qū)。 2.供試綿羊mtDNAD-loop序列的長(zhǎng)度范圍為522 bp～683 bp，共有19種分子類(lèi)型。這種長(zhǎng)度變異除了少數(shù)堿基的缺失和插入之外，主要是由于D-loop區(qū)存在2～5個(gè)75 bp的串連重復(fù)序列所致。但這種序列長(zhǎng)度的變異在單倍型中的出現(xiàn)是隨機(jī)的，并不能作為單

5、倍型的序列特征。 3.本試驗(yàn)所獲得的93條綿羊mtDNA D-loop序列，共發(fā)現(xiàn)了63種單倍型，共有73個(gè)變異位點(diǎn)，其中單一多態(tài)位點(diǎn)有30個(gè)，簡(jiǎn)約信息位點(diǎn)有43個(gè)。除了缺失和插入位點(diǎn)外，還包括22處堿基轉(zhuǎn)換和1處堿基顛換，轉(zhuǎn)換和顛換之比為14.8。說(shuō)明綿羊線粒體堿基替換存在轉(zhuǎn)換偏倚現(xiàn)象。 4.本試驗(yàn)所獲得的93條綿羊mtDNA D-loop序列單倍型多樣度和核苷酸多樣性分別為0.981、0.02900，平均核苷酸差異數(shù)

6、K為9.309，反映了中國(guó)綿羊品種遺傳多樣性較貧乏。 5.對(duì)D-loop區(qū)所測(cè)個(gè)體的所有單倍型利用MEGA 4.0進(jìn)行NJ，UPGMA和ME聚類(lèi)時(shí)，中國(guó)綿羊mtDNA D-loop單倍型序列聚類(lèi)成A、B、和C三大支系。為了增加結(jié)果的可靠性，借用GenBank己發(fā)表的摩佛倫羊、赤羊、(羊原)羊、盤(pán)羊和家綿羊的D-Mop區(qū)序列與本研究中的所有序列一同聚類(lèi)，結(jié)果摩佛倫羊聚在B單倍型組中，說(shuō)明摩佛倫羊與家綿羊的關(guān)系較近。而赤羊自成一類(lèi)，