龍須菜（Gracilaria lemaneiformis）微衛(wèi)星標(biāo)記的篩選及品系間多態(tài)性分析.pdf

1、龍須菜(Gracilaria lemaneiformis)已經(jīng)成為我國繼海帶和紫菜之后的第三大栽培海藻，不僅是江蘺屬的一個重要的產(chǎn)瓊膠物種，而且還是遺傳學(xué)研究的好材料。因此，進(jìn)行龍須菜的基礎(chǔ)研究，對更好地開發(fā)其經(jīng)濟(jì)效益具有重要意義和推動作用。微衛(wèi)星(SSR)是一種廣泛用于遺傳多樣性、系統(tǒng)發(fā)生和種質(zhì)鑒定等領(lǐng)域的分子標(biāo)記技術(shù)。本論文從三個方面對龍須菜微衛(wèi)星進(jìn)行了初步的開發(fā)，并對開發(fā)出的微衛(wèi)星進(jìn)行了多態(tài)性檢測及種間轉(zhuǎn)移擴(kuò)增。 1.利用

2、生物信息學(xué)方法，從公開發(fā)表的龍須菜公共核苷酸數(shù)據(jù)庫中尋找多態(tài)信息含量豐富的微衛(wèi)星位點(diǎn)，在篩選出的微衛(wèi)星位點(diǎn)中選取序列，成功設(shè)計合成了5對引物，并在青島野生龍須菜群體中進(jìn)行多態(tài)性檢測。結(jié)果顯示，5對引物均有擴(kuò)增產(chǎn)物，但卻未檢測到多態(tài)性。 2.從江蘺屬其它種的EST數(shù)據(jù)庫中查找微衛(wèi)星位點(diǎn)，根據(jù)Gracilaria changii的EST序列設(shè)計合成了10對微衛(wèi)星引物。通過對青島野生龍須菜群體中的多態(tài)性檢測，其中1對引物的擴(kuò)增產(chǎn)物具有

3、多態(tài)性。 3.為了獲得更多的微衛(wèi)星引物，通過查找相關(guān)文獻(xiàn)獲得江蘺屬其他種(細(xì)江蘺Gracilaria gracilis)的4對已知微衛(wèi)星引物，用在龍須菜上進(jìn)行引物種間轉(zhuǎn)移擴(kuò)增研究，有2對引物在龍須菜中有具多態(tài)性的擴(kuò)增產(chǎn)物。實驗獲得的微衛(wèi)星引物可用來進(jìn)行龍須菜種群遺傳多樣性研究、遺傳圖譜構(gòu)建。 此外，為比較龍須菜不同品系及江蘺屬不同物種在微衛(wèi)星位點(diǎn)的差異，我們將從龍須菜核酸公共數(shù)據(jù)庫中查找到的微衛(wèi)星引物在相關(guān)品系和相關(guān)種間