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文檔簡介
1、背景:
丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)是感染人體后,導(dǎo)致肝細胞損傷,繼而引起肝臟炎癥、變性、壞死,甚至終末期肝病,如肝硬化、肝癌等。這除與感染HCV病毒基因型有關(guān)外,還與宿主免疫狀態(tài)、細胞因子基因型及表達水平等原因有關(guān)。人體在感染HCV后,大約20%的感染者能自發(fā)清除病毒,自發(fā)性清除依賴于宿主和病原體相關(guān)的因素,宿主免疫反應(yīng)在自發(fā)清除中占重要地位,當(dāng)這種免疫應(yīng)答不能徹底清除 HCV時,將會導(dǎo)致慢性感
2、染的發(fā)生。而慢性炎癥會促使肝臟組織纖維大量增生,甚至導(dǎo)致相關(guān)性肝硬化、肝癌的發(fā)生。因此丙型肝炎感染的結(jié)局除了病毒因素之外,還存在種族人群的差異。由此表明宿主遺傳因素對疾病的發(fā)生、預(yù)后具有重要影響。
人類基因組計劃研究顯示人類基因的同源性為99.9%,僅0.1%的差異就決定了人們遺傳性狀的不同、對某些疾病易感性的不同及對某些藥物治療反應(yīng)效果的不同,這些差異集中表現(xiàn)在核苷酸位點的變異,被稱為單核苷酸多態(tài)性(single nucle
3、otide polymorphisms,SNPs)。目前國內(nèi)外已有多個研究發(fā)現(xiàn)位于染色體19的編碼干擾素λ-3的IL28B基因具有SNP,其中rs12980275、rs8099917、rs12979860三個位點的變異與HCV自發(fā)清除、干擾素治療應(yīng)答相關(guān)性較大,且存在種族差異。但有關(guān)IL28B以上三個位點的變異與HCV病毒載量、肝功能之間的關(guān)系研究相對較少,特別是廣東地區(qū)IL28B基因多態(tài)性與HCV病毒載量、基因型和肝功能之間的關(guān)系的研
4、究尚未見報道,廣東地區(qū)IL28B基因多態(tài)性rs12980275、rs8099917、rs12979860三個位點的分布及其與長效干擾素療效的相關(guān)報道尚少。
研究目的:
研究廣東地區(qū)IL28B基因多態(tài)性的分布特點及其與HCV病毒載量、基因型和肝功能之間的關(guān)系,研究其與長效干擾素抗病毒療效之間的關(guān)系,探討 IL28B多態(tài)性在 HCV感染相關(guān)疾病中的可能作用,探討是否可將IL28B基因型作為臨床轉(zhuǎn)歸、療效預(yù)測的判斷指標(biāo)。<
5、br> 研究對象及研究方法:
1.選擇我院診斷符合中華醫(yī)學(xué)會傳染病和寄生蟲病學(xué)分會與肝病學(xué)分會于2008年聯(lián)合制定的《丙型肝炎防治指南》標(biāo)準(zhǔn)的慢性丙型肝炎(chronic hepatitis C,CHC)患者94例,其中74例給予抗HCV治療(長效干擾素聯(lián)合利巴韋林治療)。標(biāo)本收集方法:對于74例抗病毒治療患者,收集患者治療前,治療4周、12周、24周、48周和停藥后24周的外周靜脈抗凝血,分離血漿和外周血單個核細胞(per
6、ipheral blood mononuclear cells,PBMC);對于20例未行抗病毒治療患者,只收集患者一次外周靜脈抗凝血,分離血漿和PBMC。
2.提取患者PBMC中基因組DNA,設(shè)計特異性引物分別擴增包含IL28B基因rs12980275、rs12979860及rs8099917的區(qū)域,測序分析各SNP位點基因型。
3.采用中山大學(xué)達安基因股份有限公司試劑盒熒光定量聚合酶鏈反應(yīng)法測定血漿HCV載量。<
7、br> 4.采用丙型肝炎病毒分型特異性引物及熒光探針,應(yīng)用一步法聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)結(jié)合Taqman技術(shù),對丙型肝炎病毒進行1型和非1型的熒光PCR分型檢測(上海之江生物科技股份有限公司)。
5.肝功能檢測:采用全自動生化分析儀檢測(儀器廠家:日本OLYMPUS AU2700)。
6.所有數(shù)據(jù)采用SPSS16.0進行統(tǒng)計分析學(xué)處理,計量資料采用t檢驗,計數(shù)資料根據(jù)數(shù)據(jù)情況采用卡方檢驗或精確概率計算法檢驗;P<0.05為差
8、異有統(tǒng)計學(xué)意義。
研究內(nèi)容及研究結(jié)果:
1.94例慢性HCV感染者均完成宿主IL28B基因測序,rs12980275位點基因型為AA、AG、GG各75(79.8%)、19(20.2%)、0(0%)例;rs12979860位點基因型為CC、CT、TT各78(83.0%)、16(17.0%)、0(0%)例;rs8099917位點基因型為TT、TG、GG各82(87.2%)、12(12.8%)、0(0%)例。
2
9、.94例患者中共有89例進行了HCV基因分型檢測,其中HCV-1型占74.2%,HCV-非1型占25.8%,兩者之間有顯著統(tǒng)計學(xué)差異(P>0.005)。
3.94例患者入組時均進行了肝功能及HCV-RNA載量的檢測,IL28B rs12980275、rs12979860、rs8099917三個位點的變異與血清總膽紅素(TB)、天門冬氨酸氨基轉(zhuǎn)移酶(AST)、白蛋白(ALB)、膽堿酯酶(CHE)、血漿凝血酶原時間(PT)及HCV
10、-RNA水平均無關(guān)系(P>0.05);rs8099917、rs12980275位點的變異與丙氨酸氨基轉(zhuǎn)移酶(ALT)的水平無關(guān)(P>0.05),而rs12979860位點基因型為CC者,其ALT水平較CT者高,結(jié)果有統(tǒng)計學(xué)意義(P=0.008)。
4.74名慢性HCV感染者長效干擾素聯(lián)合利巴韋林治療后RVR率為66.2%,SVR率為77.0%。HCV-1型感染者與HCV-非1型感染者長效干擾素療效無明顯差異(P>0.05)。對
11、HCV-1型患者,僅rs12979860 CC型與SVR有關(guān),結(jié)果有統(tǒng)計學(xué)差異(SVR組 vs. Non SVR組,88.4% vs.58.3%,P<0.05);對HCV-非1型患者,rs8099917、rs12979860、rs12980275三個位點與RVR、SVR均無關(guān),結(jié)果無統(tǒng)計學(xué)差異(P>0.05)。
研究結(jié)論:
1.廣東地區(qū)慢性HCV感染者IL28B基因rs12980275、rs12979860、rs80
12、99917位點分別以AA(占79.8%)、CC(占83.0%)、TT(占87.2%)為主;
2.rs12980275、rs12979860、rs8099917三個位點的變異與廣東地區(qū)慢性HCV感染者的外周血HCV-RNA水平均無關(guān);rs12979860 CC型者具有較高的ALT水平;
3.廣東地區(qū)慢性HCV感染者使用長效干擾素+利巴韋林聯(lián)合治療后能獲得較好的臨床療效;
4.對于慢性HCV-1型感染者,rs1
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