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文檔簡介
1、異化鐵還原微生物(Dissimilatory Iron-Reducing Microorganism,DIRM)是一類能夠以Fe(Ⅲ)為外部電子受體進(jìn)行代謝的微生物,它們廣泛分布于厭氧環(huán)境中。
從東太平洋洋中脊熱液區(qū)采集的兩個(gè)硫化物樣品(22VI-EPR-S019-TVG13和22VI-EPR-S025-TVG19)中,采用蛋白胨鐵氧化物培養(yǎng)基分離純化獲得兩株嗜熱厭氧異化鐵還原細(xì)菌,分別命名為DY22613T和DY2261
2、9T。
菌株DY22619T是一株嚴(yán)格厭氧細(xì)菌,其細(xì)胞呈長桿狀,菌體大小為2-6 um×0.5μm,有多個(gè)周生鞭毛,具有游動(dòng)性。溫度生長范圍為40-70℃,最適生長溫度為60℃;pH生長范圍為4.5-8.5,最適pH值為7.0;鹽度生長范圍為10-100g/L海鹽,最適生長鹽度為30g/L海鹽。在最適生長條件下,最短代時(shí)為0.92小時(shí)。異養(yǎng)生長可利用蛋白質(zhì)類和糖類如蛋白胨、胰蛋白胨、酵母膏、牛肉浸膏、半乳糖、葡萄糖和多種氨
3、基酸作底物。以蛋白胨為電子供體,可還原正方形針鐵礦(Akaganeite)、無定形羥基氧化鐵(Amorphous FeOOH)、無定形氧化鐵(Amorphous ferric oxide)以及硫酸鈉,微弱還原針鐵礦(Goethite),不能利用可溶性的檸檬酸鐵和氯化鐵、強(qiáng)晶態(tài)的赤鐵礦(Hematite)、單質(zhì)硫和硝酸鈉作電子受體。菌株DY22619T的基因組G+C含量是29.5 mol%。該菌株與Caloranaerobacter az
4、orensis MV1087T的相似度最高(97.4%),16S rDNA序列號(hào)為KC794016。根據(jù)該菌株與Caloranaerobacter azorensis MV1087T在基因型和表型上的差異,我們提出DY22619T代表了Caloranaerobacter屬的一個(gè)新的種,并且命名為Caloranaerobacterferrireducens sp.nov.
菌株DY22613T是一株嚴(yán)格厭氧細(xì)菌,其細(xì)胞呈長桿
5、狀,菌體大小為10-15μm×0.5 u m,有多個(gè)周生鞭毛,具有游動(dòng)性。溫度生長范圍為45-70℃,最適生長溫度為60-65℃;pH生長范圍為5.0-9.0,最適pH值為7.0;鹽度生長范圍為10-80g/L海鹽,最適生長鹽度為35g/L海鹽。在最適生長條件下,最短生長代時(shí)為0.91小時(shí)。異養(yǎng)生長可利用蛋白質(zhì)類和糖類如蛋白胨、胰蛋白胨,酵母膏,牛肉浸膏、半乳糖、葡萄糖和多種氨基酸作底物。以蛋白胨為電子供體,可還原正方形針鐵礦(Akag
6、aneite)、無定形羥基氧化鐵(Amorphous FeOOH)、無定形氧化鐵(Amorphous ferric oxide)以及硫酸鈉,微弱還原針鐵礦(Goethite),而不能利用可溶性的檸檬酸鐵和氯化鐵、強(qiáng)晶態(tài)的赤鐵礦(hematite)、單質(zhì)硫和硝酸鈉作電子受體。其基因組G+C含量是36.7%。該菌株的16S rDNA序列號(hào)為KC794016,與來自鹽湖的嗜熱嗜鹽菌Halothermothrix orenii的相似度最高(87
7、%)。根據(jù)該菌株與Halothermothrix orenii在基因型和表型上的較大差異,我們提出DY22619T代表了一個(gè)新屬。
透析袋實(shí)驗(yàn)和透析管實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)DY22619T和DY22613T可以不依賴直接接觸而還原胞外的鐵氧化物,推測其可能利用電子穿梭體(electron shuttle)將電子傳遞給胞外的鐵氧化物。添加0.1mM的AQDS(一種人工電子穿梭體)使這兩株細(xì)菌的鐵還原能力分別提高了11.7%和74.0%。而
8、添加4mM NTA(一種人工螯合劑),并沒有對(duì)這兩株細(xì)菌的鐵還原速率有顯著的促進(jìn)。因此,電子穿梭機(jī)制可能是這兩株細(xì)菌還原鐵的重要機(jī)制。醌類物質(zhì)在模式生物Shewanellaspp.中已被證明具有重要的電子穿梭功能,在這兩株細(xì)菌鐵還原培養(yǎng)液的上清中也發(fā)現(xiàn)有大量的醌類物質(zhì),其分離純化工作正在展開,以進(jìn)一步分析其化學(xué)結(jié)構(gòu),并且探究這些醌類物質(zhì)在電子傳遞過程中的作用。
菌株DY22619T和DY22613T的基因組草圖已完成測序,
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