法醫(yī)學(xué)常用15個STRs的檢測及其應(yīng)用于人群遺傳關(guān)系推斷的研究.pdf

1、背景和目的:
　　 短串聯(lián)重復(fù)序列一般是由兩個或多個核苷酸為核心序列的重復(fù)出現(xiàn)而組成的串聯(lián)結(jié)構(gòu),以重復(fù)區(qū)域為中心的片段長度一般在400bp以內(nèi),重復(fù)單位為2～6bp,重復(fù)次數(shù)可達10～60次。由于不同STRs位點的核心序列不同,而同一STR位點在不同人中的重復(fù)次數(shù)不同,導(dǎo)致出現(xiàn)個體差異,構(gòu)成了長度多態(tài)性,廣泛應(yīng)用于個體識別和親權(quán)鑒定。由于STRs具有分布廣、信息量大、高度多態(tài)性以及遵循孟德爾共顯性遺傳等特點,也成為推斷民族遺傳距

2、離的有效工具。
　　 哈薩克族是哈薩克斯坦的主要民族和中國的少數(shù)民族,人口1700萬。在中國主要分布于新疆維吾爾自治區(qū)伊犁哈薩克自治州、木壘哈薩克自治縣、巴里坤哈薩克自治縣、甘肅省阿克塞哈薩克族自治縣。該民族使用文字是以阿拉伯字母為基礎(chǔ)的哈薩克語,按語言系屬分類,屬于突厥語族人種。按血統(tǒng)分類,屬于蒙古人種北亞類型和歐羅巴人種及印度地中海類型之間的混合類型,屬于混血民族。
　　 由于部分哈薩克人仍以游牧生活為主,無固定居住

3、區(qū)域,且地理位置較為偏僻,交通不便,經(jīng)濟發(fā)展欠發(fā)達等多重原因,我國哈薩克族人群的15個基因座數(shù)據(jù)資料至2011年10月一直未見報道。因?qū)熃M有機會從新疆合作單位取得新疆哈薩克族血樣,特對這些血樣進行法醫(yī)學(xué)常用STR基因座的檢測。
　　 然后,本研究通過公用數(shù)據(jù)庫或同行評議期刊等網(wǎng)絡(luò)資料庫,收集了中國各個省份、其它各個民族的STR基因座頻率數(shù)據(jù)。通過對40個不同民族群體間遺傳距離的計算,構(gòu)建了多個民族間的系統(tǒng)發(fā)生樹,以探討其遺傳關(guān)

4、系。
　　 方法:
　　 使用酚-氯仿法對100例新疆哈薩克族外周血樣進行DNA提取,使用Identifiler試劑盒進行熒光標(biāo)記PCR擴增,而后使用3130DNA測序儀對PCR產(chǎn)物進行毛細(xì)管電泳,最后完成對新疆哈薩克族100例健康無親緣性個體的15個STR基因座遺傳多態(tài)性的研究。
　　 通過公用數(shù)據(jù)庫或同行評議期刊等資料庫收集中國各個省份、各個民族其它群體的STR基因座頻率數(shù)據(jù);將獲得的文獻數(shù)據(jù)與新疆哈薩克族的

5、遺傳數(shù)據(jù),篩選匯總后計算出9個法醫(yī)學(xué)常用STR位點(D13S317、D18S51、D21S11、D3S1358、D5S818、D7S820、D8S1179、FGA、vWA)在中國40個民族中的基因頻率,以phylip3.69統(tǒng)計軟件包計算遺傳距離,并通過Neighbor-joining法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)生樹,研究各民族間的遺傳關(guān)系。
　　 結(jié)果:
　　 對100例新疆哈薩克族的15個STR基因座進行檢測分別檢出了10、15、8

6、、10、6、6、7、6、12、11、8、6、12、7、10個等位基因,其基因頻率分布范圍分別在0.01～0.25,0.005～0.275,0.01～0.225,0.015～0.33,0.01～0.335,0.01～0.285,0.015～0.24,0.025～0.265,0.015～0.205,0.015～0.29,0.02～0.26,0.01～0.595,0.005～0.255,0.025～0.365以及0.005～0.205之間。<

7、br>　　 比較所有40個族群的9個STRs基因座基因頻率數(shù)據(jù)計算出了遺傳距離,并根據(jù)遺傳距離采用Neiglabor-joining法構(gòu)建了40個族群之間的系統(tǒng)發(fā)生樹。在樹狀圖上,可以看出在系統(tǒng)發(fā)生樹的下半部分,新疆維吾爾族先與內(nèi)蒙古蒙古族首先聚合,然后再與新疆哈薩克族、內(nèi)蒙古達斡爾族、天津漢族,青海回族分別聚合,繼而與青海藏族、西藏藏族、西藏珞巴族,浙江畬族的亞類相聚合,再與陜西漢族、云南白族,天津朝鮮族、湖南土家族、山東漢族、江蘇

8、漢族相聚合。然后與河北漢族、內(nèi)蒙古漢族、河南漢族,遼寧漢族形成的漢族亞類相聚合,構(gòu)成了整個北方人群。系統(tǒng)發(fā)生樹上半部分,廣西毛南族和廣西京族首先聚合,繼而與廣西苗族、廣西仫佬族聚合,與廣西瑤族和海南黎族聚合的亞類聚合。接下來與廣西瑤族、海南漢族相聚合。廣西侗族、廣西壯族。廣西漢族、廣東漢族的亞類與之相聚合后,又與四川漢族、福建漢族以及湖北漢族以及重慶土家族聚合,構(gòu)成南方人群。而安徽漢族、浙江漢族,構(gòu)成了南方漢族和北方漢族之間的過渡人群。