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文檔簡介
1、目的:
纖毛(cilium/cilia)是從一些原核細胞和真核細胞表面伸出的突起,由三個主要部分組成:中央軸絲、圍繞它的質(zhì)膜和一些細胞質(zhì)。纖毛在脊椎動物體內(nèi)的廣泛存在可以解釋當其結(jié)構(gòu)或功能出現(xiàn)障礙時出現(xiàn)的復雜多樣的疾病或表型。目前已知存在纖毛功能不全的有腎、視網(wǎng)膜組織以及神經(jīng)管、發(fā)育中的肢體、胰腺、肝臟、脾、骨骼及中樞神經(jīng)系統(tǒng)的一些部分。這些疾病因病因?qū)W及遺傳學方面的重疊而被歸入一個大類,統(tǒng)稱為纖毛相關(guān)疾病(Ciliopa
2、thies)。日前的研究數(shù)據(jù)可幫助我們在這類疾病中發(fā)現(xiàn)新的基因突變,另外在認識纖毛相關(guān)疾病的癥狀方面也大有幫助。
Bardet-Biedl綜合征(Bardet-Biedl syndrome,BBS)是一種罕見的與纖毛相關(guān)的人類常染色體隱性遺傳疾病,影響人體多個系統(tǒng)。其主要臨床癥狀包括肥胖、視網(wǎng)膜色素變性、多指(趾)畸形、多囊腎、性腺發(fā)育不全、認知障礙、高血壓及糖尿病等等。由于其多樣的臨床癥狀,使Bardet-Biedl綜合
3、征成為研究多種人類疾病分子機制的重要模型。到日前為止,共有16個BBS基因被報導,其中BBS1、2、4、5、7、8和9七種所編碼的蛋白共同構(gòu)成Bardet-Biedl綜合征蛋白復合體BBSome。
人們對BBSome組裝過程的步驟、調(diào)節(jié)知之甚少。在體內(nèi),幾乎所有的構(gòu)成BBSome的蛋白都以BBSome復合體亞基形式存在,而極少見游離分子,這提示BBSome的組裝過程進行的非常迅速,且各中間體存在時間極短。本研究對BBSom
4、e復合體組裝的全過程進行了深入研究,嘗試建立一個BBSome組裝的模型。對BBSome組裝過程的研究將給各亞基的功能研究奠定基礎(chǔ),并給BBSome的整體功能研究提供新的思路。
材料及方法:
1、克隆及亞克隆使用的菌株、載體、工具酶等
大腸桿菌DH5α,克隆載體PSTBlue、 StrataClone,表達載體pCS2(+)-3xFlag、pCS2(+)-HA、 pCS2(+)-mycs、 pEG
5、FP-N3/C3; Expand HiFi、Expand Long TemplateDNA合成酶;所有限制性內(nèi)切酶(包括部分高保真版本)、T4 DNA連接酶、Klenow等來自NEB。所有點突變型質(zhì)粒均使用QuickChangeⅡ site-directedmutagenesis試劑盒構(gòu)建并經(jīng)測序確認。所有相關(guān)人類及小鼠基因cDNA序列信息來自UCSC Genome Browser數(shù)據(jù)庫,使用APE共享版軟件及Sequencher4.8
6、進行序列分析、內(nèi)切酶選擇、引物設計及測序結(jié)果對比篩選。
2、本研究中應用的抗體
兔抗人多克隆抗體BBS1、2、4、7,單克隆抗體anti-β-tubulin,多克隆抗體anti-β-actin,單克隆抗體anti-acetylated tubulin,單克隆抗體anti-γ-tubulin,兔抗人單克隆抗體anti-BBS8、9, thermolysin, and cycloheximide。羊anti-BB
7、S2(C-16)。大鼠anti-TCP1a and TCP1b。兔anti-ubiquitin。 Smartpool RNAi against humanBBS2, BBS10, BBS12, BBS9。
3、細胞培養(yǎng)及轉(zhuǎn)染
本研究使用的皮膚成纖維細胞取自(一)攜帶BBS10常見突變c91fs95的人類Bardet-Biedl綜合征患者;另使用293T細胞及hTERT-RPE1細胞。轉(zhuǎn)染使用lipofecta
8、mine2000或RNAiMAX。
4、免疫熒光觀察目的蛋白定位
細胞以冷甲醇與固定后PBS洗滌封閉;封閉液中稀釋日的蛋白標簽—抗在窒溫孵育后PBS洗滌;再次封閉,后以Alexa488或Alexa568標記的二抗孵育。最終以Vectashield mounting media containing DAPI裱片,并在熒光共焦顯微鏡下觀察并拍攝。
5、免疫共沉淀觀察各蛋白質(zhì)分子間相互作用
9、 使用不同標簽的人類BBS基因被共轉(zhuǎn)染入293T細胞。轉(zhuǎn)染48小時后,裂解細胞、離心。取上清以protein G beads孵育。經(jīng)孵育后的細胞裂解液再以標記有相應抗體的beads孵育,以裂解液洗滌后行Western Blot并以相應抗體檢測。
6、Western Blot檢測蛋白表達水平
取野生型及突變型雄性小鼠睪丸制備組織勻漿,Nanodrop蛋白定量。蛋白經(jīng)電泳分離、電轉(zhuǎn)至硝酸纖維素并以SuperS
10、ignal Dura extended substrate發(fā)光檢測。
7、蔗糖密度梯度離心
小鼠組織制備組織勻漿,離心,上清轉(zhuǎn)移至20-60%蔗糖梯度離心液,超速離心。取上清液并以冷丙酮沉淀,離心。沉淀以SDS-PAGE上樣緩沖液溶解并以Western Blot檢測。
8、蛋白酶敏感性實驗觀察蛋白質(zhì)穩(wěn)定性及降解情況
以分析液裂解細胞,等量蛋白與therolysin混合。終止反應后W
11、estern Blot檢測,觀察泛素化蛋白質(zhì)降解途徑下BBS蛋白的降解情況。
9、小鼠
本研究中應用了多個Bbs基因knock-in或knock-out小鼠。
結(jié)果:
1、BBS2、7、9首先形成一個三元亞復合體
BBS2、7、9之間存在較強的相互作用,這種作用強于這三種蛋白與其他BBSome組分蛋白。該三元亞復合體成為整個BBSome的核心及其他亞基蛋白組裝進入BB
12、Some的平臺。
2、BBS1及BBS4最后裝配入BBSome
BBS1的最常見錯意突變型蛋白M390R并不影響除BBS4之外BBSome其他亞基組裝進入復合體,所有BBSome亞基蛋白中BBS1及BBS4最后裝配入BBSome,BBS4的整合則依賴于BBS1的存在。
3、BBS4的定位
BBS4與PCM1的結(jié)合及定位于中心體/中心粒周圍衛(wèi)星體的過程不依賴于BBSome其它亞基,說
13、明這一定位是BBS4分子的固有屬性。
4、BBS10的調(diào)節(jié)作用
BBS10調(diào)節(jié)BBS7/12/6亞復合物及CCT/TRiC復合體之間的相互作用,且在整個BBSome的組裝過程和功能調(diào)節(jié)中發(fā)揮重要作用。
5、BBS7的釋放
BBS7從BBS分子伴侶復合體中釋放后參與形成BBS7/2/9的三元亞復合物。BBS9整合入BBSome是與CCT/TRiC復合體脫離BBS2/BBS7的過程相藕
14、連的。
6、BBS2的穩(wěn)定性
BBS2的穩(wěn)定性依賴于BBS2/BBS7/BBS9亞復合物、分子伴侶BBS蛋白及CCT/TRiC復合體。游離狀態(tài)下的BBS2最終進入泛素化途徑被蛋白酶體降解。
結(jié)論:
BBS2、7、9首先在BBS分子伴侶復合體的輔助下形成BBSome的核心三元復合體,而后BBSome的其他組分蛋白BBS1、5、8分別獨立整合入BBSome,最后BBS4依賴于BBS1的
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