廣西狂犬病毒NS基因和M基因的克隆測序與序列分析.pdf

1、本試驗(yàn)設(shè)計(jì)引物NSM1/NSM2，成功地對廣西7株狂犬病病毒Ns和M基因同時(shí)進(jìn)行了RT-PCR擴(kuò)增、克隆和測序。取其中NS和M基因的ORF核苷酸序列并推導(dǎo)其氨基酸序列，與GeneBank上公開發(fā)表的其它狂犬病毒株及本實(shí)驗(yàn)室已經(jīng)測序的9株狂犬病毒序列進(jìn)行同源性比較和遺傳進(jìn)化樹分析，以了解廣西狂犬病病毒在分子水平上的變異規(guī)律。結(jié)果顯示，這16株廣西狂犬病野毒株可分為3個(gè)群：Ⅰ群、Ⅱ群、Ⅲ群，Ⅰ群中有GXHX、GX08、GX014、GX195

2、、GXS1、GX260、GX09、GX01、GX091、GXLA共10株，Ⅱ群包括GX219、GX304、GXBM、GXPX、GX074這5株，GXN119屬于Ⅲ群。NS基因編碼區(qū)核苷酸及推導(dǎo)的氨基酸序列同源性的比較結(jié)果，Ⅰ群毒株間分別在97.1-99.8％和97.7-99.3％之間，Ⅱ群間在98.2-99.7％與97.3-99.3％之間，Ⅲ群與其它毒株在85.8-86.9％與89.9-92.3％之間，其氨基酸特異性變化位點(diǎn)包括：51、